115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0070 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  100 
 
 		 1270 aa  2560    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1550 aa  175  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1500 aa  171  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1869 aa  157  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1276 aa  155  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1276 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1276 aa  154  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1362 aa  147  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  25.97 
 
 		 1405 aa  146  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1423 aa  145  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1462 aa  141  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  29.43 
 
 		 1448 aa  136  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1404 aa  136  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1428 aa  135  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1451 aa  128  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  26.46 
 
 		 1441 aa  127  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1538 aa  127  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  32.83 
 
 		 1937 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1392 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  27.88 
 
 		 1084 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1398 aa  122  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1783 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1206 aa  120  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  25.95 
 
 		 1463 aa  119  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  28.3 
 
 		 1530 aa  118  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1463 aa  118  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1396 aa  116  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  25.74 
 
 		 2140 aa  115  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1406 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1395 aa  114  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  25.2 
 
 		 2032 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1578 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1510 aa  110  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1515 aa  109  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1448 aa  108  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  26.11 
 
 		 1550 aa  105  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1319 aa  103  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1335 aa  102  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1346 aa  97.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1489 aa  95.1  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1434 aa  94  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  24.43 
 
 		 1424 aa  94  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1501 aa  93.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1487 aa  92  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1377 aa  89.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1443 aa  87.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1308 aa  86.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1292 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1056 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.07 
 
 		 1184 aa  81.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1184 aa  81.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1361 aa  77.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1352 aa  77.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.37 
 
 		 1243 aa  75.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1453 aa  74.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1325 aa  72.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1262 aa  72.4  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1221 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1297 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1256 aa  69.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1221 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1304 aa  68.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1174 aa  67  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1290 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1353 aa  66.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1273 aa  66.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  23.1 
 
 		 1273 aa  66.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1392 aa  65.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1218 aa  65.1  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  23.29 
 
 		 1285 aa  64.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1401 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  22.32 
 
 		 1359 aa  63.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  20.05 
 
 		 1310 aa  63.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1319 aa  63.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  20.69 
 
 		 1705 aa  62.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  21.99 
 
 		 1485 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1226 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  19.18 
 
 		 1246 aa  60.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1328 aa  58.5  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1317 aa  58.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  21.99 
 
 		 1485 aa  58.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  23.14 
 
 		 1249 aa  57.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  23.2 
 
 		 1285 aa  57  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  20.74 
 
 		 1224 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17710  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1430 aa  56.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  19.95 
 
 		 1453 aa  56.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1232 aa  55.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  25.66 
 
 		 1507 aa  55.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1448 aa  55.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  25.66 
 
 		 1507 aa  55.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  20.44 
 
 		 846 aa  54.3  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1504 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1355 aa  53.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1305 aa  52.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  18.81 
 
 		 1378 aa  53.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1299 aa  52.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1259 aa  52.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1259 aa  52.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1505 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  21.08 
 
 		 1259 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>