123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4472 on replicon NC_011668
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 428 aa  884    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  30.06 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  29.1 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  28.33 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  34.01 
 
 		 422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  30.69 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  29.66 
 
 		 411 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  30.42 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  28.97 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  32.4 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  27.09 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  40.8 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  30.42 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  27.41 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  30.53 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  29.68 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.56 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  28.65 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  28.91 
 
 		 416 aa  120  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  24.64 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  27.58 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  29.66 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  29.66 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  41.33 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  26.54 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  24.78 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  28.57 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3030  restriction modification system DNA specificity subunit  37.93 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.49 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  24.66 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  27.54 
 
 		 485 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  25.37 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  26.75 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.84 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  26.19 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  24.77 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.59 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  24.74 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  23.59 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  23.69 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  23.4 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  37.98 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.49 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  24 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  24.55 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.5 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  26.01 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  30 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  25.71 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.33 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  23.23 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  21.23 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  25.65 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  22.12 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  27.23 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  24.93 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  25.6 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.86 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  23.15 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  24.88 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  22.14 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  26.09 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  27.67 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  22.18 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  24.29 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  28.89 
 
 		 612 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  21.58 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  23.32 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  25.12 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  23.83 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3055  restriction modification system DNA specificity subunit  24.4 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.363566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  21.84 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.64 
 
 		 462 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.25 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  26.07 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  26.07 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  39.47 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  19.17 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  21.99 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.88 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  22.44 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  26.83 
 
 		 528 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  22.29 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  20.9 
 
 		 465 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  20.27 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.18 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  28.42 
 
 		 563 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  28.42 
 
 		 561 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  21.07 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  24.78 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.82 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.91 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.05 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  23.4 
 
 		 590 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  20 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.32 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  22.85 
 
 		 476 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  19.75 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1500  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.43 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.100633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  20.49 
 
 		 425 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>