223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0315 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 360 aa  751    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  62.96 
 
 		 352 aa  471  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  54.26 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  54.39 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  52.68 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  53.67 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  55.98 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  54.13 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  52.69 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  53.6 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  51.69 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  53.78 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  53.94 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  52.15 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  52 
 
 		 348 aa  362  6e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  52.15 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  51.29 
 
 		 348 aa  362  6e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  50.72 
 
 		 350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  51.72 
 
 		 349 aa  359  5e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  49.14 
 
 		 386 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  48.72 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  54.44 
 
 		 347 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  53.58 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  52.45 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  51.03 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  51.14 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  52.59 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  52.87 
 
 		 348 aa  346  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  52.87 
 
 		 348 aa  345  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  49 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  49.85 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  52.59 
 
 		 348 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 354 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  47.79 
 
 		 399 aa  339  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  48.83 
 
 		 381 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  47.85 
 
 		 375 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  49.13 
 
 		 402 aa  325  7e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  46.84 
 
 		 625 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  44.48 
 
 		 368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  46.13 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  44.99 
 
 		 626 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  44.99 
 
 		 626 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  44.99 
 
 		 626 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  43.82 
 
 		 395 aa  308  8e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  46 
 
 		 380 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 		 385 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  44.57 
 
 		 374 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  43.34 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  43.54 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  44.02 
 
 		 515 aa  299  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  42.78 
 
 		 373 aa  298  9e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 		 394 aa  295  8e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  40.22 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  41.6 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.44 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  43.94 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  39.19 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  39.55 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  39.27 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 		 359 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 		 373 aa  275  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  40.41 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  42.04 
 
 		 353 aa  272  8.000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  39.61 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  38.98 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  38.79 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  39.5 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  40.84 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  38.48 
 
 		 376 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  39.56 
 
 		 429 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  38.94 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  39.77 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  38.24 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  36.51 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  41.77 
 
 		 842 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  36.54 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  37.39 
 
 		 397 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 		 372 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  38.7 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  37.18 
 
 		 354 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  37.46 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  36.69 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  36.72 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  36.86 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>