72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1157 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  342  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  68.92 
 
 		 80 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  35.92 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  38.35 
 
 		 237 aa  72  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  34.56 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  34.75 
 
 		 274 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  39.57 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  33.1 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  37.62 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  37.23 
 
 		 231 aa  62  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  36.84 
 
 		 265 aa  62  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  42.68 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  37.78 
 
 		 590 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  35.03 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  44.32 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  38.52 
 
 		 242 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  35.34 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  44.68 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  32.91 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  38.35 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  42.68 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  42.35 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  36.71 
 
 		 635 aa  55.1  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  41.11 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  42.35 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  34.33 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  40 
 
 		 211 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  37.31 
 
 		 288 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  28.37 
 
 		 247 aa  51.2  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  35.77 
 
 		 316 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1497  RDD domain-containing protein  30.08 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  32.99 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  28.99 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  32.72 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  28.36 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  38.46 
 
 		 269 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  30.56 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  33.94 
 
 		 306 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  29.31 
 
 		 276 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  30.08 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  37.96 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  42.65 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  30.43 
 
 		 310 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  41.43 
 
 		 285 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  33.59 
 
 		 272 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  37.23 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  33.06 
 
 		 247 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  43.66 
 
 		 340 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  43.24 
 
 		 268 aa  44.7  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  26.7 
 
 		 264 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  36.23 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  27.47 
 
 		 272 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  29.85 
 
 		 286 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  25.85 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  28.21 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  25.38 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  32.14 
 
 		 240 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  34.29 
 
 		 241 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  29.77 
 
 		 140 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  35 
 
 		 323 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  35 
 
 		 323 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2053  RDD domain-containing protein  29.1 
 
 		 150 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  35 
 
 		 323 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  37 
 
 		 269 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  34.81 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  32.16 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  31.48 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  37.65 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  40.58 
 
 		 310 aa  40.8  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 266 aa  40.8  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>