88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0974 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  32.03 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  27.97 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  29.35 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  31.58 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1396  hypothetical protein  24.52 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.107997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  29.67 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  22.6 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  27.83 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  34.59 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  24.92 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  30.18 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  22.83 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  28.48 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  22.05 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  28.83 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  22.18 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  23.05 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  24.31 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  33.59 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  25.77 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  27.12 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  30.13 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  36.89 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  26.75 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  23.45 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  24.06 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  22.34 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3709  hypothetical protein  23.53 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12968e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  27.47 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  34.12 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  26.71 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  29.61 
 
 		 281 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0221  hypothetical protein  23.5 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  25.86 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3481  hypothetical protein  23.53 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.02728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  25.16 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3755  hypothetical protein  25.36 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  27.21 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  23.84 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  25.84 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  28.8 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  23.26 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  22.16 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  25.7 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  24.32 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  24.88 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  27.45 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1031  hypothetical protein  21 
 
 		 462 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal  0.565046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  37.04 
 
 		 348 aa  49.3  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  22.77 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  26.67 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3446  hypothetical protein  22.35 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  23.92 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  23.21 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  23.84 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3397  hypothetical protein  22.18 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  25.97 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  25 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  34.07 
 
 		 258 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  23.77 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  21.43 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3378  hypothetical protein  20.65 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  23.89 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0031  hypothetical protein  23.98 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000287545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  29.47 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  28.64 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  31.5 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4230  hypothetical protein  21.97 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  29.82 
 
 		 358 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  33.93 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0502  hypothetical protein  22.71 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000554513  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11203  hypothetical protein  20 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  23.58 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  29.19 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  26.06 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  26.09 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  24.46 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0639  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  24.03 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0501  hypothetical protein  19.53 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>