More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6528 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
415 aa  839    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  82.61 
 
 
414 aa  710    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  42.05 
 
 
421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  39.9 
 
 
412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  39.9 
 
 
412 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  37.03 
 
 
417 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  33.67 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  35.05 
 
 
432 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  31.97 
 
 
441 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
402 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.57 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.17 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 
424 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
411 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.86 
 
 
366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
423 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 
414 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.93 
 
 
410 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.93 
 
 
410 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
415 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 
436 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 
448 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.87 
 
 
426 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
399 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 
504 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.48 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
466 aa  96.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.17 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.53 
 
 
420 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 
427 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
426 aa  93.6  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.38 
 
 
437 aa  93.6  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
437 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.38 
 
 
437 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8464  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 
481 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.635867  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
424 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  27.93 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 
444 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
411 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
445 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
425 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 
457 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
432 aa  86.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 
520 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  27.21 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
431 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
410 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.07 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.86 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.17 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.07 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.07 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  25.79 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.79 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.79 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  25.79 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
475 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.55 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  25.5 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>