274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1386 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1386  beta-lactamase  100 
 
 		 453 aa  943    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000523067  unclonable  0.000000000545429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1306  beta-lactamase protein  48.2 
 
 		 490 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000704134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1072  beta-lactamase  49.02 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  28.06 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  25.74 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  25.53 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  25.87 
 
 		 375 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  34.29 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  34.29 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  33.71 
 
 		 431 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  33.71 
 
 		 431 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  24.34 
 
 		 380 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  34.9 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  33.14 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  33.9 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  30 
 
 		 407 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  32.78 
 
 		 380 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  34.48 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  34.94 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  32.45 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  29.28 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  32.24 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  29.28 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  29.28 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  23.83 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  31.38 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  24.03 
 
 		 382 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  33.13 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  29.71 
 
 		 373 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  33.73 
 
 		 384 aa  87  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  23.6 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  28.93 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  27.96 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  30.77 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  31.25 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  31.68 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  31.91 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  30.73 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  34.53 
 
 		 392 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  31.33 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  30.61 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  30.73 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  26.82 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  29.01 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  26.63 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  26.14 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  30.16 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2171  beta-lactamase  26.99 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  29.84 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  29.17 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  30.77 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  27.23 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  31.96 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.08 
 
 		 582 aa  73.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  26.78 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  36.73 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  27.37 
 
 		 737 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  23.19 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  31.67 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  31.67 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  29.76 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  30.88 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  25.41 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  30.82 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  25.28 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  32 
 
 		 784 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  28 
 
 		 717 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  26.2 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  27.78 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  29.13 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.04 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.28 
 
 		 793 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  28.57 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  28.11 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  26.46 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  22.22 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  25 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.75 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  31.25 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  30.83 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  23.56 
 
 		 364 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  27.87 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  30.53 
 
 		 566 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  31.25 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  30.53 
 
 		 792 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  26.54 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  30.97 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  24.03 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  24.87 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  24.87 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.89 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  24.03 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  24.03 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  25.46 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.11 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  22.93 
 
 		 377 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  26.87 
 
 		 391 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  27.89 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  26.34 
 
 		 450 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>