More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1106 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 755 aa  1549    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  39.84 
 
 		 758 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  38.99 
 
 		 751 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 		 849 aa  327  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  32.55 
 
 		 816 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  32.32 
 
 		 813 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  31.76 
 
 		 812 aa  317  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 843 aa  311  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 726 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 839 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 746 aa  300  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 742 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 764 aa  293  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  29.55 
 
 		 723 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 738 aa  290  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  31.59 
 
 		 733 aa  290  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 732 aa  289  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  30.08 
 
 		 732 aa  284  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 745 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 745 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  29.49 
 
 		 723 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 745 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 817 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.3 
 
 		 709 aa  249  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 808 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 698 aa  246  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 697 aa  234  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  27.35 
 
 		 714 aa  224  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 718 aa  210  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 723 aa  205  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 723 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 723 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 723 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 725 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 783 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 725 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 725 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 725 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  24.87 
 
 		 717 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 704 aa  170  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  24.7 
 
 		 713 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 739 aa  167  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  25.65 
 
 		 721 aa  167  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 809 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 817 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 701 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 710 aa  161  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 700 aa  160  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 716 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 		 724 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  25.46 
 
 		 771 aa  153  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 721 aa  153  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 701 aa  147  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  24.61 
 
 		 713 aa  145  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  22.01 
 
 		 704 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 728 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 716 aa  114  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  26.94 
 
 		 332 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 753 aa  94.4  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.18 
 
 		 750 aa  80.9  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  26.43 
 
 		 739 aa  77  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 711 aa  67  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.54 
 
 		 861 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.19 
 
 		 728 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 710 aa  62  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 688 aa  61.2  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  30.3 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 691 aa  60.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.87 
 
 		 755 aa  60.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  30.56 
 
 		 651 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 904 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  26.19 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  25.99 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  21.05 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  20.38 
 
 		 675 aa  57.4  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 726 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 698 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 904 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 724 aa  57  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  35.06 
 
 		 740 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 769 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  31.43 
 
 		 687 aa  56.6  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 761 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 698 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 731 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 698 aa  56.2  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 736 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 904 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 904 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  25.86 
 
 		 617 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  32.33 
 
 		 677 aa  55.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  29.19 
 
 		 834 aa  55.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 732 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 678 aa  55.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>