More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0436 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  67.35 
 
 		 151 aa  213  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  65.77 
 
 		 149 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  62.59 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  62.59 
 
 		 149 aa  206  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  58.22 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  56.85 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  61.49 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  43.45 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  43.45 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  39.31 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  40.69 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 147 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  38.62 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  36.6 
 
 		 305 aa  87  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.24 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.81 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  37.41 
 
 		 187 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.03 
 
 		 290 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.03 
 
 		 208 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.01 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.89 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.25 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  38.36 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.11 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.97 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  36.43 
 
 		 285 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.97 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  36.99 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  36.3 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.67 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.89 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  37.34 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.89 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.97 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  30.71 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  30.71 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  33.77 
 
 		 280 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  36.71 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.72 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.46 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  33.55 
 
 		 169 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  32.45 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  36.84 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  32 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.03 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  36.05 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.67 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  29.29 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  35.44 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.64 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  34.23 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 308 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  35.44 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.56 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  31.72 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.87 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  33.1 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  31.72 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.97 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  32 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.07 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  35.17 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.72 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.14 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  35.17 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  35.62 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.19 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.47 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34.01 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>