More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2603 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2603  porin  100 
 
 		 335 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  48.29 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  48.85 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  38.99 
 
 		 369 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  41.4 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  38.72 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  37.81 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0747  porin  33.5 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00334345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  37.61 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  36.14 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.42 
 
 		 335 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  35.85 
 
 		 349 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  35.35 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  32.96 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  32.96 
 
 		 355 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  34.25 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  35.46 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  35.61 
 
 		 362 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  35.67 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  31.97 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.18 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.18 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.41 
 
 		 436 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.83 
 
 		 386 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.83 
 
 		 386 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.83 
 
 		 386 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.83 
 
 		 386 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  32.1 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.83 
 
 		 386 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  33.13 
 
 		 362 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  35.05 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.41 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.83 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.27 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  34.55 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  34.32 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  32.35 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  33.15 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  36.5 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  38.72 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  38.72 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.72 
 
 		 383 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  34.91 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.71 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  38.72 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  32.34 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  33.23 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  33.58 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  39.71 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  34.45 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  33.33 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  31.02 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  32.64 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  31.02 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  34.46 
 
 		 353 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  33.92 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  30.64 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.84 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  28.3 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  32.93 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  31.02 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  33.43 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  32.72 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  31.51 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.69 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  32.46 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  33.33 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  33.33 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  34.66 
 
 		 380 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  31.03 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  33.33 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  30.75 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  36.59 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  31.83 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  39.05 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.44 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  38.24 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  32.25 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  34.24 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.05 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.91 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.23 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  36.44 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  32.36 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  38.1 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.56 
 
 		 379 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.93 
 
 		 363 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  34.55 
 
 		 414 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.93 
 
 		 363 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.93 
 
 		 363 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  35.78 
 
 		 406 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.93 
 
 		 363 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.93 
 
 		 363 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  33.33 
 
 		 347 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  38.26 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  38.57 
 
 		 379 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  38.57 
 
 		 380 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  32.24 
 
 		 362 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.21 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  35.68 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>