More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3480 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  570  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  45.39 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  45.39 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  41.13 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  42.46 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  45.74 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  42.61 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  41.49 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  36.07 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  31.08 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  31.42 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  34.48 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  31.38 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  33.33 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  28.76 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  30.17 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  30 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  30.27 
 
 		 297 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  31.21 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  31.6 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  28.11 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.9 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  32.18 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  30.61 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  31.88 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  31.12 
 
 		 298 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3607  hypothetical protein  36.6 
 
 		 166 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 323 aa  95.5  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  30.66 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.48 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  31.34 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.95 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  29.9 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.01 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  28.44 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  30.45 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  28.52 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  27 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  30.85 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  29.21 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  24.92 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.86 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.66 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.03 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.43 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  30 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  26.52 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  26.58 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  29.41 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.79 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  33.17 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.62 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  27.39 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.49 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  29.68 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  31.17 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  30.17 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.45 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.57 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.03 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  28.96 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  24.66 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  26.95 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.03 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  28.67 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  30.49 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  24.83 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.01 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  27.39 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.71 
 
 		 147 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  28.48 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 141 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  27.6 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.25 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  24.32 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  26.69 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  26.8 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.62 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  26.82 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.25 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.33 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  27.24 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  27.24 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  27.24 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  27.24 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  27.24 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  37.06 
 
 		 154 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  28.23 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  30.03 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>