More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0606 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  100 
 
 		 588 aa  1177    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  39.86 
 
 		 588 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  38.55 
 
 		 596 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  38.22 
 
 		 602 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  40.5 
 
 		 609 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  39.44 
 
 		 612 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  38.57 
 
 		 597 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  37.44 
 
 		 613 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  36.15 
 
 		 596 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  36.09 
 
 		 596 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  36.38 
 
 		 610 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  35.54 
 
 		 611 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  36.53 
 
 		 623 aa  364  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  36.59 
 
 		 611 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  36.35 
 
 		 593 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  35.12 
 
 		 610 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  35.12 
 
 		 630 aa  361  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  35.12 
 
 		 610 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  36.21 
 
 		 619 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  35.06 
 
 		 627 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  35.8 
 
 		 610 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  36.15 
 
 		 609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  35.19 
 
 		 588 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  35.28 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.3 
 
 		 622 aa  348  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  36.49 
 
 		 592 aa  347  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  37.42 
 
 		 605 aa  346  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  35.8 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  35.8 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  35.8 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  35.8 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  35.8 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  35.8 
 
 		 610 aa  343  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  35.6 
 
 		 610 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  37.07 
 
 		 608 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  37.07 
 
 		 608 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  36.9 
 
 		 608 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  35.63 
 
 		 610 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  36.9 
 
 		 608 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  36.9 
 
 		 608 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  35.6 
 
 		 620 aa  339  8e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  35.53 
 
 		 610 aa  339  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  37.23 
 
 		 598 aa  339  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  35.7 
 
 		 589 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  32.65 
 
 		 594 aa  334  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  32.94 
 
 		 590 aa  332  9e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  35.44 
 
 		 609 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  32.6 
 
 		 590 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  36.27 
 
 		 610 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  34.74 
 
 		 596 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  37.56 
 
 		 618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  36.11 
 
 		 610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  35.11 
 
 		 609 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  33.11 
 
 		 591 aa  323  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  35.23 
 
 		 606 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  34.86 
 
 		 593 aa  321  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  33.93 
 
 		 616 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  33.94 
 
 		 593 aa  320  5e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  32.94 
 
 		 613 aa  320  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  35.04 
 
 		 592 aa  319  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  33.62 
 
 		 632 aa  316  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  34.02 
 
 		 593 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  36.22 
 
 		 581 aa  314  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33.9 
 
 		 616 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.23 
 
 		 588 aa  314  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  34.13 
 
 		 592 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  35.05 
 
 		 609 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  34.78 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  33.69 
 
 		 608 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  34.48 
 
 		 592 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  35.97 
 
 		 593 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  34.48 
 
 		 592 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  30.68 
 
 		 619 aa  309  9e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  37.11 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  34.4 
 
 		 614 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 		 608 aa  306  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  31.9 
 
 		 592 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  31.52 
 
 		 591 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  32.72 
 
 		 588 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  33.83 
 
 		 604 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  34.57 
 
 		 588 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  34.8 
 
 		 627 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  33.51 
 
 		 599 aa  299  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  35.08 
 
 		 599 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  30.65 
 
 		 624 aa  296  8e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  34.81 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  31.61 
 
 		 621 aa  296  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  34.81 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  33.22 
 
 		 588 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 605 aa  293  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  31.88 
 
 		 620 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33.33 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  33.27 
 
 		 590 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.32 
 
 		 589 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  31.85 
 
 		 641 aa  287  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  33.78 
 
 		 591 aa  287  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  30.71 
 
 		 613 aa  286  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  32.02 
 
 		 609 aa  286  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  32.57 
 
 		 600 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.39 
 
 		 588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>