More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1443 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 743 aa  1480    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 707 aa  291  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 721 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 714 aa  274  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 714 aa  274  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 677 aa  273  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 815 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 709 aa  258  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 860 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 708 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 719 aa  253  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 817 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 827 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 708 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 708 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 850 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 726 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.3 
 
 		 724 aa  243  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 795 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 703 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 701 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.98 
 
 		 703 aa  240  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 796 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 795 aa  238  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.39 
 
 		 709 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.27 
 
 		 713 aa  237  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 858 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.27 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 713 aa  235  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 837 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.98 
 
 		 696 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 711 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 696 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 825 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.85 
 
 		 711 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 821 aa  231  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  27.97 
 
 		 699 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 796 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 810 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 796 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 710 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 809 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 796 aa  227  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 766 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 855 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 855 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 863 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 770 aa  224  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 710 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1441  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  26.98 
 
 		 841 aa  221  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.877786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 710 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 709 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.19 
 
 		 703 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 742 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 710 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.33 
 
 		 708 aa  217  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 843 aa  216  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 741 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 881 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 881 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 793 aa  215  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 679 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 881 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 882 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 705 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 921 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 921 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 734 aa  212  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 792 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 719 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 701 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 706 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 778 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 706 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  27.01 
 
 		 690 aa  207  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 714 aa  207  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 703 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 781 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 706 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.01 
 
 		 706 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 859 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  26.47 
 
 		 716 aa  205  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 712 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 712 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 720 aa  201  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 702 aa  200  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 702 aa  200  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 864 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 693 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 709 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 710 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 738 aa  198  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 689 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 709 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 702 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 726 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 707 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 736 aa  196  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 582 aa  195  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>