More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1441 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1441  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  100 
 
 		 841 aa  1731    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.877786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 743 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 858 aa  193  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 863 aa  193  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 855 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 855 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 799 aa  178  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 707 aa  178  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 796 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 828 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 796 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 796 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 821 aa  170  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  23.22 
 
 		 809 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 815 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.9 
 
 		 708 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 793 aa  167  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.48 
 
 		 703 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 829 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 779 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  24.08 
 
 		 799 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 796 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.4 
 
 		 703 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 703 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 721 aa  165  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 705 aa  164  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 827 aa  164  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 701 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 817 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  23.64 
 
 		 808 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 778 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  24.97 
 
 		 716 aa  160  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 709 aa  159  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 797 aa  158  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 817 aa  157  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 831 aa  157  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 719 aa  157  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 712 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 735 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.51 
 
 		 696 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 726 aa  151  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  23.7 
 
 		 801 aa  150  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 714 aa  150  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  22.94 
 
 		 791 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 850 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 714 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 742 aa  149  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 677 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 791 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 860 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 808 aa  147  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  23.96 
 
 		 720 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  23.81 
 
 		 797 aa  146  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 825 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 709 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 837 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 714 aa  145  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 825 aa  145  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 696 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 795 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 		 692 aa  144  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 882 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 881 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 881 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 795 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  23.05 
 
 		 729 aa  141  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 781 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 732 aa  141  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 921 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 921 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 881 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 582 aa  140  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  23.02 
 
 		 740 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 679 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 712 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 689 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 705 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  21.34 
 
 		 740 aa  138  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 		 712 aa  138  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  22.66 
 
 		 843 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 699 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.51 
 
 		 806 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 766 aa  137  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  22.97 
 
 		 810 aa  137  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 736 aa  137  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  22.97 
 
 		 806 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 812 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 770 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 		 701 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  24.45 
 
 		 711 aa  136  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 		 710 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  22.38 
 
 		 710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 698 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 710 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 724 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  22.27 
 
 		 724 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  22.13 
 
 		 734 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 723 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>