More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28412 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_28412  predicted protein  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.9 
 
 
805 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  36.65 
 
 
764 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.1 
 
 
718 aa  149  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.37 
 
 
731 aa  149  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  36.18 
 
 
379 aa  149  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.19 
 
 
731 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.42 
 
 
810 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.65 
 
 
804 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.37 
 
 
731 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  34.53 
 
 
713 aa  146  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.65 
 
 
736 aa  145  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.05 
 
 
727 aa  145  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  35.43 
 
 
754 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.36 
 
 
805 aa  145  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.8 
 
 
731 aa  145  9e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  34.8 
 
 
393 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.49 
 
 
800 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.3 
 
 
723 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.1 
 
 
781 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  35.18 
 
 
405 aa  143  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.1 
 
 
784 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.25 
 
 
757 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  36.19 
 
 
404 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1752  AAA ATPase central domain protein  37.15 
 
 
424 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  35.46 
 
 
763 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  34.18 
 
 
429 aa  141  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  33.81 
 
 
775 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  34.07 
 
 
405 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.25 
 
 
719 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.06 
 
 
756 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.6 
 
 
754 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.26 
 
 
732 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.85 
 
 
709 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.66 
 
 
808 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  35.48 
 
 
394 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.6 
 
 
754 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  35.57 
 
 
552 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.07 
 
 
753 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.8 
 
 
760 aa  139  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.86 
 
 
754 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.49 
 
 
763 aa  138  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.07 
 
 
769 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.86 
 
 
759 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.69 
 
 
736 aa  137  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  35.46 
 
 
404 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.47 
 
 
768 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  35.32 
 
 
408 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.1 
 
 
739 aa  137  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  34.63 
 
 
410 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  34.94 
 
 
446 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.55 
 
 
742 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.25 
 
 
772 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.51 
 
 
738 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  40.71 
 
 
756 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.9 
 
 
737 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  35.4 
 
 
387 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  33.99 
 
 
806 aa  136  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  34.45 
 
 
412 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.65 
 
 
738 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.55 
 
 
620 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.37 
 
 
721 aa  136  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  34.4 
 
 
404 aa  136  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  34.66 
 
 
389 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.51 
 
 
737 aa  135  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.73 
 
 
701 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  33.21 
 
 
405 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  37.71 
 
 
550 aa  135  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.13 
 
 
735 aa  135  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  32.67 
 
 
722 aa  135  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  33.47 
 
 
436 aa  135  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.86 
 
 
781 aa  135  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  33.88 
 
 
607 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.47 
 
 
738 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2330  AAA ATPase central domain protein  33.99 
 
 
458 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  37.99 
 
 
729 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.69 
 
 
740 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.94 
 
 
622 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.13 
 
 
742 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  33.07 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  34.25 
 
 
390 aa  133  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.37 
 
 
673 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.37 
 
 
673 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  33.73 
 
 
426 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  37.15 
 
 
473 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.62 
 
 
715 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  36.65 
 
 
638 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  37.94 
 
 
699 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.97 
 
 
806 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  34.5 
 
 
599 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl672  cell division protein  40 
 
 
650 aa  132  7.999999999999999e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  32.54 
 
 
732 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  36.59 
 
 
464 aa  132  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  37.15 
 
 
648 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  34.27 
 
 
431 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  33.6 
 
 
829 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.2 
 
 
730 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  32.3 
 
 
407 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 
614 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  34.35 
 
 
826 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>