139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4016 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 169 aa  347  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  69.43 
 
 		 160 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  69.43 
 
 		 160 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  62.96 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  62.82 
 
 		 175 aa  220  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  53.42 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  43.12 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  43.12 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  44.7 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  44.7 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  41.95 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  39.6 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  39.6 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  39.88 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  42.64 
 
 		 197 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  40.25 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  32.61 
 
 		 1202 aa  71.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  29.8 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  27.69 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  30.97 
 
 		 560 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17510  hypothetical protein  30.4 
 
 		 335 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  36.21 
 
 		 428 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  29.84 
 
 		 572 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  28.24 
 
 		 461 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1520  hypothetical protein  29.6 
 
 		 335 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  30.17 
 
 		 354 aa  51.2  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  30.34 
 
 		 469 aa  51.2  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  28.19 
 
 		 567 aa  50.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  34.94 
 
 		 620 aa  50.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  35.56 
 
 		 1361 aa  50.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 446 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.93 
 
 		 448 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 444 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.57 
 
 		 446 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.97 
 
 		 590 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  30.89 
 
 		 403 aa  48.5  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 444 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 444 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  33 
 
 		 441 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  33.07 
 
 		 1059 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  29.75 
 
 		 439 aa  47.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.43 
 
 		 428 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 1279 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  30.1 
 
 		 1078 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  28.21 
 
 		 435 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  27.27 
 
 		 658 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  29.51 
 
 		 960 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  30.89 
 
 		 1042 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  26.79 
 
 		 463 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.71 
 
 		 442 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.53 
 
 		 444 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  31.97 
 
 		 560 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  34.48 
 
 		 437 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  27.87 
 
 		 438 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.22 
 
 		 442 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.14 
 
 		 445 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.72 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  32.29 
 
 		 728 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.13 
 
 		 436 aa  45.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.69 
 
 		 407 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  26.62 
 
 		 445 aa  44.7  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.1 
 
 		 497 aa  44.7  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  31.53 
 
 		 374 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1021 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  32.98 
 
 		 442 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  32.98 
 
 		 442 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  32.98 
 
 		 442 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  28.16 
 
 		 1077 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  31.25 
 
 		 669 aa  44.3  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  24.03 
 
 		 581 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  26.29 
 
 		 440 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  30.08 
 
 		 457 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  30.19 
 
 		 442 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  26.52 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  26.14 
 
 		 1206 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  22.31 
 
 		 437 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  25.48 
 
 		 629 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 461 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.33 
 
 		 292 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  26.72 
 
 		 439 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  28.71 
 
 		 434 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  31.37 
 
 		 428 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  30.77 
 
 		 316 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  34.45 
 
 		 815 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.7 
 
 		 429 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  32.09 
 
 		 430 aa  42.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  31.62 
 
 		 352 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 423 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  30 
 
 		 442 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  30 
 
 		 442 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 423 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.95 
 
 		 667 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.13 
 
 		 403 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.05 
 
 		 407 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  30 
 
 		 442 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1001 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  31.91 
 
 		 442 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  31 
 
 		 442 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>