96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0520 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  80.33 
 
 		 184 aa  309  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  60.48 
 
 		 190 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  60.48 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  59.64 
 
 		 174 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  50.29 
 
 		 197 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  46.04 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  46.04 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  42.86 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  42.86 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  39.88 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.27 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  37.82 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  37.82 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  39.72 
 
 		 175 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  39.26 
 
 		 175 aa  97.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  30.07 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  34.59 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  27.45 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  28.3 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  29.86 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.596766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  29.46 
 
 		 438 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  30 
 
 		 435 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  30.71 
 
 		 440 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  26.75 
 
 		 560 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.38 
 
 		 403 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 436 aa  48.5  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  27.69 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  28.35 
 
 		 421 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  24.37 
 
 		 442 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  24.37 
 
 		 442 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  24.37 
 
 		 442 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  26.05 
 
 		 441 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  24.37 
 
 		 442 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.8 
 
 		 427 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 442 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  31.72 
 
 		 426 aa  47  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 442 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  23.97 
 
 		 432 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 442 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  40 
 
 		 431 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.77 
 
 		 1028 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  31.25 
 
 		 1059 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 431 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 431 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 431 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 431 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 442 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 431 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 442 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 442 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.25 
 
 		 428 aa  45.1  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1048 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 431 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 426 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 463 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 430 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 430 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 442 aa  44.7  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  39.13 
 
 		 438 aa  44.7  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  35.05 
 
 		 430 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  34.02 
 
 		 432 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  35.05 
 
 		 430 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  38.57 
 
 		 463 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  38.89 
 
 		 421 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  25.19 
 
 		 437 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 451 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.92 
 
 		 443 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  25.69 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.16 
 
 		 444 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  35.05 
 
 		 430 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  25.19 
 
 		 440 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 440 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  32.31 
 
 		 425 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.99 
 
 		 440 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  32.17 
 
 		 442 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.92 
 
 		 440 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  28.33 
 
 		 461 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  27.73 
 
 		 432 aa  42.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 425 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  37.14 
 
 		 433 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  37.14 
 
 		 431 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  37.14 
 
 		 463 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  37.14 
 
 		 433 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.99 
 
 		 446 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  27.69 
 
 		 434 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.74 
 
 		 446 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  24.37 
 
 		 441 aa  41.2  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.8 
 
 		 427 aa  41.2  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  25.52 
 
 		 441 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  25.95 
 
 		 618 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.02 
 
 		 497 aa  41.2  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.52 
 
 		 1078 aa  41.2  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30.16 
 
 		 1229 aa  41.2  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  26.4 
 
 		 444 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.29 
 
 		 428 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>