175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0146 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  100 
 
 		 287 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  72.48 
 
 		 288 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  48.41 
 
 		 285 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  60.22 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  58.62 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  58.62 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  59.09 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  59.09 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  51.61 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  57.95 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  55.68 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  55.68 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  50 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  50 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  37.16 
 
 		 212 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  48.39 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  48.86 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  56.32 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  48.28 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  55.17 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  47.78 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  49.45 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  37.41 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.71 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  43.82 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  43.33 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  45.45 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  43.82 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  46.61 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  46.61 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  50 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  41.46 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  42.68 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  42.22 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  46.15 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  33.96 
 
 		 248 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  37.14 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  45.88 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  43.9 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  44.71 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  37.08 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  44.74 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  41.56 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  44.14 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  45.12 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  31.68 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  44.3 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.52 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  35.34 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  43.94 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  42.5 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  42.5 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40.26 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  38.46 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40.26 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  38.04 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  36.59 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  38.04 
 
 		 137 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  34.94 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  35.06 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  31.96 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  26.42 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  29.9 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  34.12 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.14 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  29.9 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  30.77 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  33.01 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.85 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  28.47 
 
 		 938 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  30.93 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  30.93 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  30.93 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  36.71 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  35.9 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  36.26 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  41.33 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  41.33 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  36.9 
 
 		 223 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  35.8 
 
 		 138 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  29.28 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  41.98 
 
 		 140 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0339  TonB family protein  40.32 
 
 		 597 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  31.87 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  39.24 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  35.37 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  29.11 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  36.54 
 
 		 190 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.76 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1664  TonB/TolA energy transducing protein  30.85 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0106366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  35 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  32.91 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  36.71 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.71 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  27.13 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  31.07 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  35.44 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  35.9 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.56 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  28.41 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>