278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0058 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  69.85 
 
 		 483 aa  691    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  69.75 
 
 		 488 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  95.84 
 
 		 481 aa  952    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  68.81 
 
 		 483 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  69.34 
 
 		 488 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  69.38 
 
 		 483 aa  679    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 481 aa  991    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  68.61 
 
 		 483 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  72.29 
 
 		 483 aa  719    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.19 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  42.13 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  41.67 
 
 		 482 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  38.28 
 
 		 478 aa  286  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.53 
 
 		 514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  34.74 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  34 
 
 		 513 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  35.28 
 
 		 507 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  34.32 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.03 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  33.54 
 
 		 505 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  34.24 
 
 		 481 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  29.31 
 
 		 496 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1685  altronate oxidoreductase  77.5 
 
 		 80 aa  140  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00119512  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.37 
 
 		 373 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.55 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  27.71 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.25 
 
 		 386 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  27.62 
 
 		 492 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  29.43 
 
 		 430 aa  127  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  27.11 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.87 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.21 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.08 
 
 		 378 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.48 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  26.64 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  30.67 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.67 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.05 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.82 
 
 		 494 aa  120  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  29.5 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.9 
 
 		 383 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.47 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.47 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  30.24 
 
 		 386 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  27.14 
 
 		 458 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  26.57 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  23.67 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  22.38 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  30.41 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  25.2 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  25.6 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.6 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  27.12 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  24.9 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  26.64 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  24.9 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  23.16 
 
 		 486 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  24.9 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.05 
 
 		 486 aa  110  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  24.17 
 
 		 488 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  25.61 
 
 		 489 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  23.77 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.77 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  23.16 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.77 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  23.77 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  24.71 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  23.77 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  23.96 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  28.15 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  26.43 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.29 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.6 
 
 		 505 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  23.16 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  24.69 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  26.19 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  23.16 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.38 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  23.16 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  24.34 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.01 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  26.87 
 
 		 488 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.35 
 
 		 487 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  23.83 
 
 		 488 aa  106  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2129  Mannitol dehydrogenase domain  32.62 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  26.74 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.12 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  25.18 
 
 		 520 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.19 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.52 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  26.74 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>