More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1228 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1228  RNA-binding protein  100 
 
 		 131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0834946  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1710  RNA-binding protein  44.88 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.034913  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0448  RNA-binding protein  43.2 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.308089 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  36.59 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  49.32 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  49.32 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  35.71 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  36.07 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  35.97 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  41.03 
 
 		 598 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  38.82 
 
 		 568 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  40.7 
 
 		 558 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  38.82 
 
 		 568 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  38.82 
 
 		 568 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  38.16 
 
 		 578 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  44.16 
 
 		 570 aa  64.3  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  39.74 
 
 		 584 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  45.83 
 
 		 302 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  45.83 
 
 		 302 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  44.16 
 
 		 587 aa  63.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  41.03 
 
 		 584 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 503 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  37.33 
 
 		 539 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  39.74 
 
 		 584 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  34.62 
 
 		 586 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  39.74 
 
 		 557 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  37.08 
 
 		 604 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  31.76 
 
 		 504 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  37.33 
 
 		 562 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  38.27 
 
 		 760 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3572  RNA binding S1 domain protein  37.21 
 
 		 557 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0027  30S ribosomal protein S1  36.26 
 
 		 566 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.173864  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0026  30S ribosomal protein S1  36.26 
 
 		 566 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  36.84 
 
 		 573 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  33.63 
 
 		 568 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  33.63 
 
 		 568 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.59 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.59 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  43.84 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10960  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  35.23 
 
 		 743 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000522629  unclonable  0.00000000397306 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 		 588 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.47 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0029  30S ribosomal protein S1  36.26 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  43.84 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  42.47 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0644  30S ribosomal protein S1  38.16 
 
 		 611 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.35055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  35.53 
 
 		 574 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  38.67 
 
 		 694 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  32.99 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.66 
 
 		 672 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  37.18 
 
 		 557 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  31.76 
 
 		 577 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  32.99 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.33 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 599 aa  58.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  38.67 
 
 		 555 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  40.26 
 
 		 592 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  34.09 
 
 		 644 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  38.89 
 
 		 595 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  38.82 
 
 		 558 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  36.84 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  32 
 
 		 331 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  36.17 
 
 		 343 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  32 
 
 		 331 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  34.67 
 
 		 579 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.17 
 
 		 341 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.43 
 
 		 514 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  42.86 
 
 		 720 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  37.65 
 
 		 558 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0349  30S ribosomal protein S1  37.97 
 
 		 586 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000135822  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  37.65 
 
 		 558 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  34.78 
 
 		 564 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  32 
 
 		 573 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.36 
 
 		 403 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  34.78 
 
 		 564 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 562 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  35.53 
 
 		 609 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3643  RNA binding S1 domain protein  28.45 
 
 		 292 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 559 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.79 
 
 		 415 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1618  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.79 
 
 		 532 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  36.49 
 
 		 589 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  36.49 
 
 		 592 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  35.14 
 
 		 563 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_008639  Cpha266_0418  30S ribosomal protein S1  36.49 
 
 		 591 aa  57  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000167097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 562 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  35.14 
 
 		 563 aa  57  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1379  RNA binding S1 domain protein  35.11 
 
 		 552 aa  57  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  31.2 
 
 		 328 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 562 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>