191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0627 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  100 
 
 		 995 aa  1892    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  38.56 
 
 		 989 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  38.25 
 
 		 986 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  36.9 
 
 		 1047 aa  349  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  31.03 
 
 		 1020 aa  317  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  30.31 
 
 		 1018 aa  314  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  29.5 
 
 		 1018 aa  301  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  29.62 
 
 		 1018 aa  293  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  28.45 
 
 		 1018 aa  293  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  29.43 
 
 		 1018 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  29.34 
 
 		 1018 aa  283  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  28.6 
 
 		 1018 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  28.76 
 
 		 1018 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  28.6 
 
 		 1018 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  28.34 
 
 		 1018 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  27.66 
 
 		 1018 aa  273  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  42.17 
 
 		 962 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  27.6 
 
 		 1018 aa  270  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  49.18 
 
 		 1291 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  26.82 
 
 		 1029 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  26.64 
 
 		 1029 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  27.1 
 
 		 1029 aa  266  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  26 
 
 		 1029 aa  264  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.48 
 
 		 1029 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.48 
 
 		 1029 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.52 
 
 		 1030 aa  256  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.88 
 
 		 1029 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  46.78 
 
 		 1249 aa  255  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  21.47 
 
 		 1009 aa  238  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  24.63 
 
 		 1059 aa  232  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  37.13 
 
 		 881 aa  230  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  45.75 
 
 		 986 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  24.59 
 
 		 1033 aa  212  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  40.39 
 
 		 1046 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  49.17 
 
 		 1191 aa  197  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  25.78 
 
 		 1039 aa  194  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  57.83 
 
 		 1025 aa  193  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  39.53 
 
 		 995 aa  191  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  38.55 
 
 		 1058 aa  191  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  27.4 
 
 		 906 aa  187  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  47.26 
 
 		 1023 aa  184  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  30.5 
 
 		 1018 aa  180  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  44.55 
 
 		 1020 aa  178  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  27.27 
 
 		 1029 aa  174  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  36.43 
 
 		 1020 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  27.21 
 
 		 1029 aa  171  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  27.03 
 
 		 1029 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  27.39 
 
 		 1029 aa  169  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  31.43 
 
 		 953 aa  163  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  36.81 
 
 		 1018 aa  160  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  35.85 
 
 		 1022 aa  158  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  24.28 
 
 		 1009 aa  153  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  24.28 
 
 		 1009 aa  153  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  38.62 
 
 		 1013 aa  151  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  53.71 
 
 		 1009 aa  151  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  20.95 
 
 		 961 aa  149  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  34.14 
 
 		 1018 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  34.2 
 
 		 1024 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  25.16 
 
 		 1032 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  48.31 
 
 		 1006 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  36.7 
 
 		 1081 aa  132  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  38.1 
 
 		 1049 aa  132  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.32 
 
 		 1108 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  35.68 
 
 		 1038 aa  128  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  39.52 
 
 		 1017 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  26.27 
 
 		 1165 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  37.04 
 
 		 1046 aa  115  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  32.89 
 
 		 1085 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  35.92 
 
 		 1011 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  25.87 
 
 		 1172 aa  111  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  35.03 
 
 		 1172 aa  111  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  31.42 
 
 		 1091 aa  110  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  25.92 
 
 		 1346 aa  108  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  37.74 
 
 		 1234 aa  108  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  31.9 
 
 		 1238 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  39.88 
 
 		 1226 aa  106  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  30.07 
 
 		 1303 aa  105  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  29.95 
 
 		 1230 aa  105  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  36.2 
 
 		 1223 aa  105  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  29.57 
 
 		 1307 aa  105  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  28.06 
 
 		 1223 aa  104  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  42.07 
 
 		 1219 aa  104  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  29.87 
 
 		 1214 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  38.04 
 
 		 1224 aa  104  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  32.75 
 
 		 1164 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  44.44 
 
 		 1226 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  42.24 
 
 		 910 aa  102  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  30.41 
 
 		 1091 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  25.97 
 
 		 1048 aa  102  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  36.24 
 
 		 1137 aa  102  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  31.53 
 
 		 1214 aa  101  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  32.54 
 
 		 1232 aa  101  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  31.19 
 
 		 1088 aa  101  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  27.2 
 
 		 1114 aa  101  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  26.01 
 
 		 1047 aa  101  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  26.01 
 
 		 1047 aa  101  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  26.15 
 
 		 1048 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  26.06 
 
 		 1047 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1048 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  32.35 
 
 		 1214 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>