More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3462 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  100 
 
 		 406 aa  823    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  42.82 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  39.53 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  42.6 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  38.76 
 
 		 395 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  38.96 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  40.78 
 
 		 397 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  37.86 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  38.82 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  41.09 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2728  beta-lactamase  40.21 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  37.69 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  40.15 
 
 		 401 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  42.08 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  42.08 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  39.18 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  40.2 
 
 		 400 aa  252  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2284  hypothetical protein  39.79 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  37.82 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  39.84 
 
 		 760 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  35.4 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44235  predicted protein  29.07 
 
 		 397 aa  179  7e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  29.31 
 
 		 433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  31.68 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05422  beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07500)  29.37 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300599  normal  0.931508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  33.52 
 
 		 427 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  33.33 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  30.96 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  28.13 
 
 		 424 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  29.82 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  29.13 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  29.89 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  29.97 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  28.97 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  29.8 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  30.67 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  30.13 
 
 		 370 aa  143  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  30.71 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  30.71 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88817  1,4-butanediol diacrylate esterase  29.34 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  33.52 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  28.93 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  30.71 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  30.65 
 
 		 613 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  30.81 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  29.1 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  31.76 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  29.89 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  27.16 
 
 		 427 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  34.56 
 
 		 436 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  30.11 
 
 		 409 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  31.23 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  27.66 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  31.96 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  30.05 
 
 		 415 aa  136  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  31.86 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  28.47 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  29.8 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  33.78 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  28.15 
 
 		 408 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  29.53 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  29.05 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  31.62 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  28.42 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  27.38 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  29.72 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  27.63 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  27.37 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  31.65 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  31.5 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  28.83 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  31.29 
 
 		 438 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  31.7 
 
 		 384 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  27.82 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  28.98 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  28.07 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  27.44 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  27.82 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  29.78 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  30.79 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  27.09 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  30.96 
 
 		 414 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  29.19 
 
 		 431 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  30.62 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  29.73 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  29.41 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  29.41 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  27.86 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  29.16 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  30.05 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.88 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  28.25 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  30.37 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  29.53 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  29.05 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  29.36 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  28.24 
 
 		 397 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  29.55 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  28.99 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  30.3 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>