212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1420 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  58.67 
 
 		 622 aa  767    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 615 aa  1270    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  34.99 
 
 		 663 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  37.05 
 
 		 650 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  35.53 
 
 		 668 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  35.55 
 
 		 670 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  33.75 
 
 		 647 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  34.8 
 
 		 645 aa  355  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  32.9 
 
 		 615 aa  306  6e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  30.04 
 
 		 649 aa  269  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.74 
 
 		 569 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  27.31 
 
 		 644 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25.85 
 
 		 644 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  28.16 
 
 		 642 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  27.56 
 
 		 604 aa  176  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  26.42 
 
 		 647 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  26.71 
 
 		 611 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  25.84 
 
 		 673 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  26.23 
 
 		 627 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  27.01 
 
 		 621 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  26.82 
 
 		 621 aa  164  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  26.03 
 
 		 621 aa  162  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  26.8 
 
 		 621 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  25.34 
 
 		 610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  24.93 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  24.56 
 
 		 602 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  24.55 
 
 		 584 aa  95.5  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  22.35 
 
 		 583 aa  82  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  23.48 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  22.55 
 
 		 578 aa  76.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  22.49 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.93 
 
 		 801 aa  74.7  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  21.47 
 
 		 821 aa  75.1  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  20.76 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  23.37 
 
 		 619 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.71 
 
 		 802 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  23.36 
 
 		 622 aa  72.8  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  24.23 
 
 		 870 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.49 
 
 		 803 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  23.37 
 
 		 619 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  22.33 
 
 		 597 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.7 
 
 		 1505 aa  68.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  22.28 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  22.11 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  22.78 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  22.05 
 
 		 677 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  22.05 
 
 		 677 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  23.53 
 
 		 610 aa  67  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  22.22 
 
 		 636 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  22.17 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  22.05 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  19.15 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  22.34 
 
 		 659 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  22.19 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  23.68 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  23.82 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  22.05 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  21.34 
 
 		 672 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  21.31 
 
 		 626 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  22.67 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  23.6 
 
 		 611 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  22.12 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  23.36 
 
 		 599 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  22.87 
 
 		 592 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  21.2 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  22.47 
 
 		 605 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  21.73 
 
 		 629 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  22.28 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  22.78 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  21.79 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  22.32 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  22.81 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  20.04 
 
 		 777 aa  60.8  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  23 
 
 		 635 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  21.53 
 
 		 605 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  22.9 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  21.34 
 
 		 668 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  20.43 
 
 		 598 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  21.64 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  20.93 
 
 		 868 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  22.11 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  22.11 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.93 
 
 		 838 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  22.38 
 
 		 592 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  22.11 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.83 
 
 		 837 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  21.32 
 
 		 627 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  22.44 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.63 
 
 		 761 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  23.52 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  22.39 
 
 		 594 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  20.57 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0489  hypothetical protein  22.59 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0709  glycoside hydrolase 15-related  25.07 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  23.96 
 
 		 636 aa  57.4  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  22.33 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  20.78 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  22.25 
 
 		 609 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.28 
 
 		 840 aa  57.4  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  20.67 
 
 		 598 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>