More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1512 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 782 aa  1594    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  40.77 
 
 		 411 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  40.77 
 
 		 411 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  49.5 
 
 		 518 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 700 aa  276  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 709 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  28.64 
 
 		 705 aa  245  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 693 aa  217  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 708 aa  211  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 687 aa  208  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 773 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 703 aa  196  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  27.28 
 
 		 710 aa  195  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  26.65 
 
 		 717 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 721 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 734 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 751 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 721 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 727 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 727 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 738 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 675 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 711 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 777 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 704 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 696 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 688 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  26.71 
 
 		 737 aa  180  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 729 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 723 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 720 aa  177  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.52 
 
 		 774 aa  177  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 731 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 730 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  25.55 
 
 		 731 aa  174  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  25.78 
 
 		 782 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 774 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  25.81 
 
 		 774 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  25.81 
 
 		 774 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 782 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 774 aa  171  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 774 aa  171  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 809 aa  171  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  25.67 
 
 		 774 aa  170  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  25.52 
 
 		 712 aa  170  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 747 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.98 
 
 		 809 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 809 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 809 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 880 aa  161  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 764 aa  160  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  25.18 
 
 		 690 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.76 
 
 		 713 aa  157  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 821 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 807 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.83 
 
 		 784 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 739 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.4 
 
 		 784 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.97 
 
 		 784 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 731 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 736 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 813 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  22.02 
 
 		 846 aa  98.2  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.45 
 
 		 760 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  24.58 
 
 		 760 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 798 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 688 aa  92.8  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 731 aa  92  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 792 aa  89  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 656 aa  88.6  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 742 aa  88.2  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 792 aa  87.4  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 715 aa  86.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.1 
 
 		 681 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 697 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 715 aa  84.7  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 778 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  20.85 
 
 		 807 aa  84.3  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 701 aa  83.2  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  22.05 
 
 		 788 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 694 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  21.77 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 723 aa  81.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.98 
 
 		 706 aa  81.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.98 
 
 		 706 aa  81.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 747 aa  80.9  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 700 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.98 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.43 
 
 		 712 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.84 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.56 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 800 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 779 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  23.5 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 720 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 728 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  21.64 
 
 		 690 aa  77.8  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 715 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 718 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>