More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0771 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  84.79 
 
 		 388 aa  667    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 388 aa  769    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  96.13 
 
 		 388 aa  742    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  95.36 
 
 		 388 aa  737    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  72.68 
 
 		 391 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  36.78 
 
 		 558 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  38.51 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  36.34 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  35.2 
 
 		 486 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 507 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  35.85 
 
 		 485 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  32.37 
 
 		 537 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  42.5 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  34.47 
 
 		 497 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  30.79 
 
 		 546 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  40.77 
 
 		 529 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  39.09 
 
 		 510 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  30.33 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  27.86 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  38.59 
 
 		 564 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  27.91 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  29.09 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  27.06 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  26.04 
 
 		 461 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  28.25 
 
 		 411 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  26.3 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  28.07 
 
 		 735 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  28.53 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  25.05 
 
 		 470 aa  110  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  27.23 
 
 		 399 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  26.04 
 
 		 461 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  26.85 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.5 
 
 		 853 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  23.85 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  23.85 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  24.79 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  27.92 
 
 		 503 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  29.6 
 
 		 441 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  27.59 
 
 		 445 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  27.25 
 
 		 554 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  23.5 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  23.62 
 
 		 419 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  27.36 
 
 		 512 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  24.26 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  27.08 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  26.32 
 
 		 534 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 843 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  28.5 
 
 		 449 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  28.5 
 
 		 449 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.16 
 
 		 849 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  23.73 
 
 		 554 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  25.44 
 
 		 534 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  32.3 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  26.62 
 
 		 554 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  22.3 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  27.2 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  24 
 
 		 487 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  24.72 
 
 		 535 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  24.12 
 
 		 531 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  22.86 
 
 		 554 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  28.52 
 
 		 656 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  23.81 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  26.27 
 
 		 638 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  24.6 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  23.81 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  23.47 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  23.13 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  25.07 
 
 		 534 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.47 
 
 		 856 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  25.59 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  24.87 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  26.49 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.16 
 
 		 848 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  24.6 
 
 		 734 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  25.54 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25 
 
 		 785 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.12 
 
 		 844 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  25.28 
 
 		 501 aa  83.2  0.000000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.12 
 
 		 845 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  25.57 
 
 		 532 aa  83.6  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  24.93 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25 
 
 		 785 aa  83.2  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  24.88 
 
 		 556 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  24.78 
 
 		 532 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  24.15 
 
 		 594 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  24.15 
 
 		 594 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.72 
 
 		 846 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  24.5 
 
 		 740 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.32 
 
 		 839 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  26 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  25.57 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  25.82 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  27.2 
 
 		 613 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  23.86 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.77 
 
 		 755 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  27.2 
 
 		 613 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  27.2 
 
 		 613 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  27.42 
 
 		 619 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.33 
 
 		 846 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.3 
 
 		 754 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>