More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2789 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  50.95 
 
 		 233 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 244 aa  194  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  52.83 
 
 		 239 aa  193  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  49.27 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  49.27 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  46.08 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  43.63 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  45.32 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  43.78 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 235 aa  118  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  38.27 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  37.31 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  40.62 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  36.6 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 241 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 262 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 263 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 227 aa  98.6  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  34.01 
 
 		 263 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  34.33 
 
 		 237 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>