252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5284 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 311 aa  630  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  99.68 
 
 		 353 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  99.68 
 
 		 353 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  86.17 
 
 		 359 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  85.02 
 
 		 351 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  61.09 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  57.28 
 
 		 342 aa  337  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  53.4 
 
 		 354 aa  321  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  52.89 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  55.05 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  52.17 
 
 		 366 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  52.8 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  52.8 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  52.8 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  51.83 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  50.92 
 
 		 357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  51.2 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  51.38 
 
 		 363 aa  298  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  49.69 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  50.93 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  50.93 
 
 		 369 aa  288  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  48.58 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  49.69 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  48.26 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  52.24 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  50.95 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  52.34 
 
 		 352 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  49.07 
 
 		 365 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  50 
 
 		 371 aa  269  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  50.62 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  49.4 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  49.07 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  47.43 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  41.51 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  46.15 
 
 		 374 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  45.07 
 
 		 355 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  45.15 
 
 		 365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  43.38 
 
 		 341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  42.24 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  43.23 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  40.33 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  42.16 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  43.32 
 
 		 350 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  42.76 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  40.39 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  41.39 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  41.39 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  41.06 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  29.69 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  31.42 
 
 		 608 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  30.85 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  34.32 
 
 		 847 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  30.98 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  29.63 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  31.49 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.89 
 
 		 495 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.33 
 
 		 436 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.07 
 
 		 858 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  34.39 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  31.4 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  35.35 
 
 		 816 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  31.96 
 
 		 477 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.77 
 
 		 582 aa  85.5  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  31.19 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  30.36 
 
 		 864 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  26.57 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  30.92 
 
 		 513 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  30.93 
 
 		 759 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  31.51 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  30.36 
 
 		 828 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  30.17 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  31.08 
 
 		 852 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  28.91 
 
 		 758 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  28.91 
 
 		 758 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  29.63 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  29.63 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 758 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.46 
 
 		 797 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  27.76 
 
 		 822 aa  72.8  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  25.7 
 
 		 902 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  29.41 
 
 		 831 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0596  ATP dependent DNA ligase  30 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1123  DNA ligase, putative  26.07 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.91674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  29.51 
 
 		 766 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  31.06 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  25.08 
 
 		 871 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  28.92 
 
 		 833 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.27 
 
 		 594 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  29.23 
 
 		 896 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  27.68 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  30.59 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  27.33 
 
 		 901 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  33.11 
 
 		 878 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.71 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  28.81 
 
 		 867 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  27.4 
 
 		 763 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  26.53 
 
 		 877 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  30.79 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 833 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  31.64 
 
 		 815 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>