More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3024 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  90.86 
 
 		 197 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  75.54 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  75.54 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  75.54 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 233 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  36.57 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  30.48 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  29.29 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  29.83 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  32.65 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.89 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  34.58 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  30.39 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.15 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.15 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.15 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
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NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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