136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2503 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  100 
 
 
249 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  80.66 
 
 
263 aa  412  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  79.31 
 
 
240 aa  379  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  69.58 
 
 
240 aa  347  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  70.59 
 
 
241 aa  347  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  69.75 
 
 
240 aa  343  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  66.67 
 
 
239 aa  333  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  66.52 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  60.42 
 
 
259 aa  295  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  59.68 
 
 
259 aa  294  9e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  60 
 
 
259 aa  293  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  60 
 
 
259 aa  291  8e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  56.49 
 
 
271 aa  281  5.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  58.12 
 
 
243 aa  269  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  53.65 
 
 
271 aa  259  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.51 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.51 
 
 
251 aa  244  8e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.15 
 
 
249 aa  243  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  49.36 
 
 
247 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  50.86 
 
 
250 aa  238  6.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  49.56 
 
 
267 aa  236  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  50.64 
 
 
238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.47 
 
 
241 aa  231  6e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  48.09 
 
 
242 aa  229  4e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  50.88 
 
 
243 aa  229  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  48.32 
 
 
241 aa  228  6e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  47.93 
 
 
251 aa  227  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  49.56 
 
 
268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  45.04 
 
 
240 aa  223  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  46.03 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  44.31 
 
 
245 aa  206  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  45.41 
 
 
270 aa  203  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  46.32 
 
 
245 aa  202  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  44.49 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  41.42 
 
 
257 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  47.4 
 
 
289 aa  187  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  41.45 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  42.26 
 
 
258 aa  181  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  41.15 
 
 
237 aa  180  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  42.21 
 
 
250 aa  176  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  40.27 
 
 
253 aa  176  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  37.39 
 
 
235 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  40.87 
 
 
236 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  45.81 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  37.44 
 
 
255 aa  159  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  44.57 
 
 
231 aa  159  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 
256 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  43.48 
 
 
264 aa  157  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  32.81 
 
 
285 aa  156  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  38.05 
 
 
250 aa  155  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  34.55 
 
 
250 aa  155  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  40.18 
 
 
233 aa  155  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  42.94 
 
 
256 aa  153  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  32.85 
 
 
278 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  37.34 
 
 
252 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  33.99 
 
 
254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  33.47 
 
 
246 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  38.57 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  40.62 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  38.71 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  38.54 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  31.85 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  38.86 
 
 
299 aa  130  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  37.81 
 
 
269 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  37.81 
 
 
250 aa  122  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  29.88 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  36.47 
 
 
258 aa  108  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  32.73 
 
 
238 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  32.39 
 
 
180 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  31.19 
 
 
211 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  31.84 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  33.79 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  32 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  36.05 
 
 
200 aa  92.4  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  30.94 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  31.39 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  31.39 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  31.19 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  30.43 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  32.77 
 
 
204 aa  86.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.54 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.33 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  32.57 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  32.2 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  34.13 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  28.81 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  30.29 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.61 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  28.85 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  30.58 
 
 
212 aa  79  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  29.35 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  29.25 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  30.26 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  32.34 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  29.12 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  29.17 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  29.52 
 
 
214 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  31.14 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>