186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0441 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  481  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  80.2 
 
 		 193 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  54.35 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  53.93 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  53.93 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  54.02 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  54.65 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  54.65 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  54.02 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  53.49 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  34.89 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  55.17 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  51.14 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  51.14 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  51.14 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  46.15 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  47.25 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  46.74 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  45.65 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  43.82 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  45.45 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  52.33 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  47.73 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  45.98 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  52.33 
 
 		 264 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  46.59 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  38.12 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  42.22 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  44.32 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  42.22 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  47.06 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  42.68 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  47.06 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  47.06 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  41.46 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  45.88 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.91 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  41.56 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  40.26 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  41.98 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  38.1 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  42.17 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  36.02 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  47.06 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  44.71 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  39.53 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  40.66 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.07 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  45.45 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  41.56 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  38.46 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  41.46 
 
 		 332 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  40.82 
 
 		 218 aa  62  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.62 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  40.51 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  36.36 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  40 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.15 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  40 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  37.18 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  36.71 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  39.02 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  29.17 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4592  TonB family protein  31.82 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  39.51 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  35.06 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  34.94 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  38.1 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  29.22 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  30.26 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  33.77 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  38.27 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0897  TonB protein  29.27 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  33.33 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.22 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.22 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  34.52 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  34.52 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  35.44 
 
 		 150 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  29.67 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  40 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  28.98 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  37.23 
 
 		 138 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  33.33 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  35.71 
 
 		 475 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  27.08 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  29.9 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  41.33 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  41.33 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  35.06 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  39.74 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  39.02 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  35.8 
 
 		 170 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  27.31 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  28.83 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  35.8 
 
 		 170 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  28.85 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  35.37 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  36.25 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>