More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2149 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  100 
 
 
365 aa  741  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  5.21128e-05  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  100 
 
 
365 aa  741  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  56.03 
 
 
188 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  56.03 
 
 
188 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  49.59 
 
 
363 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  49.59 
 
 
363 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  49.59 
 
 
363 aa  133  4e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  8.11276e-08 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  51.69 
 
 
211 aa  132  7e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  54.1 
 
 
224 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  48.76 
 
 
369 aa  131  1e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  54.17 
 
 
223 aa  131  1e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  54.17 
 
 
223 aa  131  1e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  48.76 
 
 
364 aa  131  2e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  52.03 
 
 
221 aa  131  2e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.64638e-06  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  49.59 
 
 
187 aa  130  2e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  54.17 
 
 
224 aa  131  2e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  54.17 
 
 
223 aa  130  4e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.24971e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  54.17 
 
 
223 aa  130  4e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  54.17 
 
 
223 aa  130  5e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  48.59 
 
 
223 aa  130  5e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  47.93 
 
 
354 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  47.2 
 
 
202 aa  129  8e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  47.93 
 
 
353 aa  128  1e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  51.22 
 
 
221 aa  128  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  51.67 
 
 
218 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  51.67 
 
 
234 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.2944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  51.67 
 
 
218 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.76333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  51.67 
 
 
234 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  51.67 
 
 
218 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  45.31 
 
 
404 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  51.67 
 
 
218 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  51.67 
 
 
234 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  6.24175e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  51.67 
 
 
234 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  47.93 
 
 
382 aa  127  4e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  47.54 
 
 
418 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  52.5 
 
 
194 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  47.54 
 
 
407 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  37.98 
 
 
242 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  47.97 
 
 
201 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  48.74 
 
 
183 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  47.54 
 
 
404 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  47.54 
 
 
407 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  47.54 
 
 
407 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  47.54 
 
 
407 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  47.54 
 
 
407 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  47.54 
 
 
407 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  47.54 
 
 
404 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  47.11 
 
 
226 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  47.15 
 
 
226 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  48.31 
 
 
192 aa  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  40.88 
 
 
228 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  48.82 
 
 
225 aa  122  1e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  48.31 
 
 
192 aa  122  1e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  48.82 
 
 
170 aa  120  4e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  49.17 
 
 
391 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  43.7 
 
 
220 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  49.61 
 
 
476 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  50.42 
 
 
333 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  49.14 
 
 
181 aa  118  1e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  48.72 
 
 
265 aa  118  1e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.04581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  48.18 
 
 
298 aa  118  2e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  42.86 
 
 
170 aa  117  2e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  44.44 
 
 
222 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  44 
 
 
215 aa  117  4e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  43.22 
 
 
169 aa  116  7e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
230 aa  115  8e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  44 
 
 
215 aa  115  9e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  48.25 
 
 
274 aa  115  1e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  44.63 
 
 
258 aa  115  2e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  43.8 
 
 
212 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
249 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  47.37 
 
 
217 aa  112  7e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.53 
 
 
255 aa  113  7e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
248 aa  112  7e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  44.26 
 
 
215 aa  112  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.7 
 
 
205 aa  112  1e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  46.22 
 
 
225 aa  112  1e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  46.22 
 
 
226 aa  112  1e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  45.13 
 
 
266 aa  112  1e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  47.58 
 
 
370 aa  111  2e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
214 aa  111  2e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
150 aa  109  8e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  39.83 
 
 
210 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  48.21 
 
 
188 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  46.02 
 
 
216 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
150 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  44.25 
 
 
267 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  46.28 
 
 
198 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  46.28 
 
 
177 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  44.92 
 
 
532 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  40.69 
 
 
207 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  45.76 
 
 
532 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  50 
 
 
285 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
269 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.66415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
307 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
269 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  43.97 
 
 
391 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  49.09 
 
 
208 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
208 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
207 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>