More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2666 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 638 aa  1278    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  51.77 
 
 		 666 aa  618  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  45.85 
 
 		 657 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  48.03 
 
 		 644 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 688 aa  228  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  26.97 
 
 		 713 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 704 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 704 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 653 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.79 
 
 		 653 aa  151  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 653 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 653 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 653 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 652 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  26.51 
 
 		 659 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 653 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 653 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 653 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 665 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.57 
 
 		 646 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 656 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.93 
 
 		 619 aa  127  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  24.51 
 
 		 656 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 675 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 656 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  22.24 
 
 		 664 aa  107  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 704 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.69 
 
 		 613 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 593 aa  101  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 688 aa  100  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  21.38 
 
 		 690 aa  99.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 626 aa  99  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 626 aa  98.2  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 705 aa  97.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  22.58 
 
 		 690 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  21.79 
 
 		 664 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 602 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 624 aa  94.7  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 715 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 634 aa  93.2  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 706 aa  92.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 686 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  25.22 
 
 		 699 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  24.27 
 
 		 722 aa  92  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.43 
 
 		 713 aa  92  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 699 aa  91.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 735 aa  91.3  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 720 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  22.06 
 
 		 702 aa  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  22.93 
 
 		 651 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.92 
 
 		 639 aa  89  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 703 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.68 
 
 		 774 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 774 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 675 aa  88.2  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 701 aa  87.8  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 728 aa  87.4  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  21.84 
 
 		 708 aa  87.8  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 757 aa  87  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.67 
 
 		 661 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.22 
 
 		 755 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 693 aa  85.5  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 708 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.95 
 
 		 615 aa  85.1  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 641 aa  84  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 641 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 705 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 710 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  22.91 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  24.32 
 
 		 638 aa  82.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  31.72 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  22.91 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 647 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 627 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 696 aa  81.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 723 aa  81.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 683 aa  81.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  21.4 
 
 		 718 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 697 aa  80.9  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  22.6 
 
 		 618 aa  80.9  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 635 aa  80.5  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  24.22 
 
 		 620 aa  80.5  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  21.44 
 
 		 712 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  20.81 
 
 		 632 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 678 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 680 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.52 
 
 		 755 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.52 
 
 		 755 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 782 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 614 aa  78.2  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>