More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3109 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  53.89 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  50.75 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  40.31 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  33.49 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.19 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  32.66 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  32.66 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  32.66 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.81 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.81 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.81 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.81 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  29.33 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  31.84 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  31.94 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.85 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.27 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.77 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  26.87 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.28 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.69 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  30.35 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.06 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  28.79 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  31.19 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  32.04 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  26.7 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.91 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.02 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.42 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  39.74 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  40.45 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  40.45 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  25.74 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  39.74 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  42.86 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  42.86 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  42.86 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  40.82 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.21 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>