More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0079 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0079  small GTP-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1069    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125969  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1338  peptide chain release factor 3  58.64 
 
 		 528 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  57.03 
 
 		 542 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0346  peptide chain release factor 3  56.93 
 
 		 537 aa  598  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06080  peptide chain release factor 3  57.69 
 
 		 544 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38845  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  56.89 
 
 		 541 aa  594  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  57.17 
 
 		 527 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  54.53 
 
 		 538 aa  579  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0191  peptide chain release factor 3  55.41 
 
 		 535 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5464  peptide chain release factor 3  54.72 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.934757  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1328  peptide chain release factor 3  55.19 
 
 		 556 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.693943  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1516  peptide chain release factor 3  55.32 
 
 		 545 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1494  peptide chain release factor 3  55.32 
 
 		 545 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  52.78 
 
 		 540 aa  559  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1492  peptide chain release factor 3  55.13 
 
 		 569 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2802  peptide chain release factor 3  54.37 
 
 		 521 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  49.13 
 
 		 544 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 538 aa  458  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  43.69 
 
 		 563 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  43.95 
 
 		 540 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  42.77 
 
 		 548 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  43.02 
 
 		 556 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  43.99 
 
 		 543 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  42.5 
 
 		 542 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  43.22 
 
 		 555 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  42.23 
 
 		 540 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  43.38 
 
 		 539 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  43.38 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  42.42 
 
 		 542 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  42.58 
 
 		 548 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  40.87 
 
 		 545 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  42.4 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  42 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  41.49 
 
 		 545 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  41.76 
 
 		 555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  41.76 
 
 		 555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  40.34 
 
 		 545 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  40.86 
 
 		 545 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  40.56 
 
 		 583 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  41.55 
 
 		 532 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  39.5 
 
 		 533 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  38.7 
 
 		 529 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  41.48 
 
 		 542 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  42.77 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  40.12 
 
 		 526 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  41.14 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  43.75 
 
 		 533 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  44 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  43.19 
 
 		 533 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  39.92 
 
 		 520 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  39.92 
 
 		 520 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  40.76 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  40.52 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  41.52 
 
 		 528 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  40.35 
 
 		 527 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  41.44 
 
 		 526 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  43.51 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  42.59 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  39.58 
 
 		 528 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  39.46 
 
 		 526 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  42.23 
 
 		 535 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  43.51 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  39.18 
 
 		 524 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  42.8 
 
 		 538 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2646  peptide chain release factor 3  41.13 
 
 		 535 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  43.1 
 
 		 533 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  38.76 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  39.73 
 
 		 531 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  39.46 
 
 		 526 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  39.65 
 
 		 520 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  40.66 
 
 		 539 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  41.77 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  39.96 
 
 		 524 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  42.28 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  41.93 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  40.5 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  39.92 
 
 		 527 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  38.96 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  40.77 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  41.44 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  39.54 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  42.92 
 
 		 547 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3382  peptide chain release factor 3  42.41 
 
 		 526 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00211559  hitchhiker  0.00272137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  39.58 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  40.26 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1245  peptide chain release factor 3  41.54 
 
 		 533 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236346  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  42.14 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0617  peptide chain release factor 3  41.86 
 
 		 541 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  41.18 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  41.65 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  39.59 
 
 		 634 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  41.08 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3554  peptide chain release factor 3  41.77 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.93604  decreased coverage  0.000001078 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  41.6 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  42.19 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  41.65 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5926  peptide chain release factor 3  41.65 
 
 		 565 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  39.02 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  40.82 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0698  peptide chain release factor 3  42.07 
 
 		 526 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>