More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1383 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  100 
 
 
142 aa  289  9e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  64.79 
 
 
147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  47.3 
 
 
149 aa  141  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  42.96 
 
 
142 aa  128  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  46.21 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  43.79 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  43.45 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  46.81 
 
 
144 aa  123  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  44.06 
 
 
150 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  43.06 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  43.75 
 
 
144 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  44.9 
 
 
141 aa  117  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  40.43 
 
 
142 aa  116  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  39.86 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  44.68 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  43.36 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  42.86 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  46.81 
 
 
138 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  42.86 
 
 
140 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  38.71 
 
 
159 aa  104  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  38.3 
 
 
137 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  41.1 
 
 
145 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  42.47 
 
 
143 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  38.89 
 
 
141 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  39.44 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.56 
 
 
180 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  38.3 
 
 
295 aa  94.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  37.58 
 
 
295 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  35.92 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  33.57 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.93 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.9 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  36.36 
 
 
152 aa  87  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.71 
 
 
156 aa  87  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.87 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  40.28 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.01 
 
 
288 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.21 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.44 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.73 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  34.03 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.56 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.76 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  34.97 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  37.84 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.23 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.69 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.33 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  33.81 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
297 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.3 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40.67 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.33 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.42 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  33.8 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.33 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  39.16 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
449 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.81 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  33.13 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.97 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.97 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.06 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.54 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  33.57 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  33.33 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  35.42 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  37.84 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35 
 
 
307 aa  77  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.42 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  34.27 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.9 
 
 
148 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  34.27 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  36.3 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.28 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.66 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.19 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  37.59 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.48 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  32.62 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.33 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  32.64 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
297 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  35.92 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.93 
 
 
320 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  34.23 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  34.23 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>