130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2172 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  57.77 
 
 		 251 aa  294  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  58.4 
 
 		 256 aa  292  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  61.54 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  60.34 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  63.36 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  59.74 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  61.75 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  58.9 
 
 		 245 aa  267  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  49.56 
 
 		 249 aa  225  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  49.35 
 
 		 239 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  49.12 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  47.79 
 
 		 240 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  47.19 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  48.57 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  50.24 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  53.37 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  45.85 
 
 		 259 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  48.57 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  48.03 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  42.86 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  44.3 
 
 		 240 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  49.5 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  46.55 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41.41 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  40.61 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  46.15 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  39.66 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  45.19 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  44.71 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  42.79 
 
 		 241 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  39.57 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  45.45 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  39.24 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  36.86 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  41.76 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  37.67 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  37.45 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  40.72 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  40.1 
 
 		 253 aa  149  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  40.84 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  38.34 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  40.93 
 
 		 231 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  39.59 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  35.98 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  33.72 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  31.84 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  30.4 
 
 		 235 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  32.93 
 
 		 299 aa  128  8.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  40.45 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  38.04 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  31.94 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  33.66 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  31.03 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  32.73 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  30.3 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  32.91 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  30.48 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  33.33 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  31.72 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  33.2 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  28.92 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  30.71 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  32.09 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  32.09 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  38.81 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  34.66 
 
 		 180 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  30.4 
 
 		 245 aa  92.8  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  29.7 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  28.38 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  29.47 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  27 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  28.78 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.46 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  30.1 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  30.05 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  29.89 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  29.44 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  29.44 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.72 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.05 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.44 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.8 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.72 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  28.86 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  27.33 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  27.98 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  30.23 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  29.27 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  29.07 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  27.78 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.42 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  29.07 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  27.46 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  28.05 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  29.07 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  26.87 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.95 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>