More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0833 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  83.14 
 
 		 617 aa  1066    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 617 aa  1271    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  60.97 
 
 		 619 aa  722    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  49.08 
 
 		 659 aa  595  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  49.46 
 
 		 653 aa  597  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  48.39 
 
 		 655 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  47.85 
 
 		 650 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  39.76 
 
 		 624 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  39.31 
 
 		 662 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  40.2 
 
 		 646 aa  327  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  28.1 
 
 		 527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 		 599 aa  164  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.14 
 
 		 1855 aa  160  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  28.28 
 
 		 614 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  29.71 
 
 		 609 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.88 
 
 		 600 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  27.24 
 
 		 1005 aa  158  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.43 
 
 		 1942 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.86 
 
 		 593 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 925 aa  156  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 838 aa  155  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  28.55 
 
 		 622 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.12 
 
 		 1017 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.35 
 
 		 836 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  25.79 
 
 		 885 aa  144  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  26.57 
 
 		 511 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.59 
 
 		 1975 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.22 
 
 		 1891 aa  134  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.13 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.44 
 
 		 814 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.22 
 
 		 526 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  24.48 
 
 		 604 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.98 
 
 		 2068 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 		 1021 aa  117  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 		 723 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  24.36 
 
 		 739 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.65 
 
 		 620 aa  112  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.16 
 
 		 484 aa  106  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.2 
 
 		 462 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  25.7 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  25.58 
 
 		 610 aa  100  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  24.58 
 
 		 642 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  24.85 
 
 		 742 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  22.31 
 
 		 582 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.33 
 
 		 649 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  24.32 
 
 		 490 aa  97.1  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.47 
 
 		 588 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  24.46 
 
 		 607 aa  95.5  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.65 
 
 		 576 aa  95.5  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  25.46 
 
 		 522 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  31.21 
 
 		 2638 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  24.02 
 
 		 765 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  39.78 
 
 		 752 aa  90.5  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 815 aa  90.9  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  23.4 
 
 		 605 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  23.47 
 
 		 767 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  23.43 
 
 		 774 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  23.83 
 
 		 703 aa  88.6  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  23.62 
 
 		 778 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  23.94 
 
 		 605 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  23.33 
 
 		 561 aa  87.8  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  32.03 
 
 		 562 aa  87.4  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  24.68 
 
 		 605 aa  87.8  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  23.94 
 
 		 605 aa  87  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  24.23 
 
 		 564 aa  87  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  24.06 
 
 		 604 aa  87  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  24.83 
 
 		 587 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.64 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  24.58 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.41 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  22.49 
 
 		 583 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  34.78 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  22.45 
 
 		 914 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  23.86 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 619 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  32.92 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  23.86 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  23.86 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  23.86 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  23.86 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  23.86 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  24.19 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  25.21 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  24.19 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  32.3 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  25.95 
 
 		 675 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  27.92 
 
 		 676 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  24.13 
 
 		 605 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  25.43 
 
 		 566 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  35.67 
 
 		 687 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  23.94 
 
 		 605 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  22.32 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  31.12 
 
 		 676 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  25.64 
 
 		 694 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  28.57 
 
 		 600 aa  82  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.63 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  25.84 
 
 		 578 aa  81.6  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>