245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0159 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 184 aa  361  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  50.87 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  47.34 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  44.05 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  43.45 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  47.34 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  40.48 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  41.62 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  38.46 
 
 		 199 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  34.07 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.92 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  35.26 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  36.93 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  38.73 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  38.76 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  38.16 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  33.91 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  34.2 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  33.14 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  29.44 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  35.8 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  36.18 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  33.94 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  36.9 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  34.91 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  37.8 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  34.88 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  34.12 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  36.09 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  35.53 
 
 		 188 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  37.57 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 185 aa  94.4  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  32.18 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  34.91 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  35.86 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  33.14 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  32.72 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  37.14 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  37.99 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  31.76 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  31.95 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  36.36 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  37.88 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  31.72 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  38.25 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  35.34 
 
 		 180 aa  88.6  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  29.7 
 
 		 182 aa  88.2  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  36.72 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  26.4 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  36.93 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  34.86 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 189 aa  85.5  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  26.4 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  37.08 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  36.43 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  31.14 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  29.12 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  36.22 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.52 
 
 		 187 aa  84.3  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  35.43 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  39.04 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  36.69 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  34.52 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  37.93 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  30.54 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  26.78 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  30.54 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  42.22 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  40.15 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  35.4 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  34.68 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  24.02 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  23.6 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  29.76 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  40.29 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  30.49 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  23.73 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  36.36 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  28.02 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  35.36 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  31.76 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  38.97 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  28.04 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>