87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3565 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  41.13 
 
 		 1294 aa  792    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  92.7 
 
 		 1106 aa  2098    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  100 
 
 		 1110 aa  2280    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  41.92 
 
 		 812 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  45.5 
 
 		 902 aa  340  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  48.01 
 
 		 1009 aa  338  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  44.68 
 
 		 1018 aa  321  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  44.78 
 
 		 1017 aa  321  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  42.51 
 
 		 1017 aa  295  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  40.82 
 
 		 1038 aa  280  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  40.77 
 
 		 957 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  36.31 
 
 		 955 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  39.63 
 
 		 1036 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  37.08 
 
 		 1046 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  33.27 
 
 		 946 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  32.62 
 
 		 554 aa  205  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  32.57 
 
 		 534 aa  204  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  34.78 
 
 		 1053 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  30.88 
 
 		 595 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  30.24 
 
 		 593 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  37.38 
 
 		 1143 aa  163  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  38.65 
 
 		 1143 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  29.48 
 
 		 611 aa  157  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1601 aa  142  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  30.61 
 
 		 744 aa  139  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  28.16 
 
 		 1457 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.92 
 
 		 768 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  28.24 
 
 		 500 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  30.5 
 
 		 490 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.36 
 
 		 783 aa  112  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  30.3 
 
 		 1281 aa  108  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  30.32 
 
 		 789 aa  104  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  28.11 
 
 		 867 aa  69.3  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1314 aa  59.3  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1538 aa  58.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  23.45 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1537 aa  57  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  26.18 
 
 		 916 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 2082 aa  55.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  25.67 
 
 		 299 aa  55.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  25.91 
 
 		 480 aa  55.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  22.72 
 
 		 658 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  26.18 
 
 		 326 aa  52.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  26.96 
 
 		 333 aa  52  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  26.96 
 
 		 333 aa  52  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  26.96 
 
 		 333 aa  51.6  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  27.08 
 
 		 328 aa  51.6  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  26.29 
 
 		 333 aa  51.6  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  23.7 
 
 		 340 aa  51.6  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  27.16 
 
 		 333 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  26.96 
 
 		 333 aa  50.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  24.84 
 
 		 329 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  24.84 
 
 		 329 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  26.96 
 
 		 329 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  27.2 
 
 		 655 aa  49.7  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  28.15 
 
 		 656 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  30.47 
 
 		 1521 aa  49.7  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2004  hypothetical protein  26.48 
 
 		 408 aa  49.7  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  25.97 
 
 		 329 aa  49.7  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  24.13 
 
 		 901 aa  49.3  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  25.9 
 
 		 333 aa  48.9  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  29.17 
 
 		 1691 aa  48.9  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  25.69 
 
 		 806 aa  48.9  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  25.09 
 
 		 656 aa  48.9  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  27.56 
 
 		 1596 aa  48.5  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  28.93 
 
 		 1672 aa  48.5  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  25.75 
 
 		 329 aa  48.1  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.86 
 
 		 1482 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  33.88 
 
 		 353 aa  47.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  29.93 
 
 		 359 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  27.41 
 
 		 334 aa  48.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  26.15 
 
 		 712 aa  47.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  24.91 
 
 		 555 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  27.93 
 
 		 616 aa  46.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  25.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  26.54 
 
 		 321 aa  46.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  30 
 
 		 442 aa  46.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  25.17 
 
 		 321 aa  46.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1024 aa  46.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  26.7 
 
 		 658 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  25.17 
 
 		 321 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  24.83 
 
 		 321 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  26.5 
 
 		 319 aa  45.8  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  27.03 
 
 		 616 aa  45.8  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  29.25 
 
 		 359 aa  45.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  28.39 
 
 		 646 aa  45.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  23.35 
 
 		 436 aa  45.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>