More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2105 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 297 aa  596  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  64.48 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  56.48 
 
 		 302 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  49.31 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.37 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  47.67 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  45.82 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  45.15 
 
 		 302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  42.09 
 
 		 295 aa  258  7e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  45.15 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.67 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  44.82 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  41.41 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.28 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  40.74 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  41.41 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.95 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  41.41 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.62 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.62 
 
 		 296 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.62 
 
 		 296 aa  248  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.62 
 
 		 296 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.62 
 
 		 296 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  41.28 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  42.76 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.28 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.28 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  43.43 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.95 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.95 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  41.61 
 
 		 307 aa  244  9e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  41.61 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  43 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  46.05 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  46.13 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  44.11 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  44.55 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  46.2 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  45.12 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  44.07 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  43.77 
 
 		 292 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  43.96 
 
 		 306 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  40.74 
 
 		 319 aa  236  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  44.59 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  42.52 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  44.26 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  43.88 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  43.69 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  44.22 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.73 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  41.3 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  41.86 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.73 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.55 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  39.87 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  42.63 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  43.92 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 		 318 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  41.75 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 		 318 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  46.67 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  44.07 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.39 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.56 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  43.85 
 
 		 317 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.72 
 
 		 298 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.45 
 
 		 298 aa  225  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  44.29 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  45.39 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  39.66 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  44.33 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  46.31 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  43.41 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  43.71 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  43.29 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  44.04 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  46.9 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  40.75 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  43.24 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  46.31 
 
 		 343 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  36.7 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  43.1 
 
 		 298 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  43.05 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.37 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  41.95 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  42.09 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  41.84 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  42.76 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>