More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2024 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  35.22 
 
 
1041 aa  660    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  34.81 
 
 
1034 aa  664    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  35.62 
 
 
1036 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  35.39 
 
 
1038 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 
1011 aa  670    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.97 
 
 
1050 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1058 aa  2156    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  35.94 
 
 
1059 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  36.37 
 
 
1034 aa  663    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  35.45 
 
 
1046 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  34.16 
 
 
1039 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 
1053 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1058 aa  617  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  34.3 
 
 
1063 aa  613  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 
1043 aa  614  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  34.58 
 
 
1050 aa  612  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 
1043 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  35.51 
 
 
1055 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  33.84 
 
 
1496 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 
1044 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 
1095 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 
1039 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 
1055 aa  605  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  33.33 
 
 
1069 aa  601  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 
1071 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  34.41 
 
 
1470 aa  602  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 
1048 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  33.77 
 
 
1041 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 
1065 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 
1040 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.83 
 
 
1032 aa  592  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 
1058 aa  590  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 
1036 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  34.42 
 
 
1044 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 
1070 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 
1028 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 
1028 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 
1028 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  34.37 
 
 
1049 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 
1047 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.17 
 
 
1024 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 
1034 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  32.87 
 
 
1066 aa  555  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  33.18 
 
 
1075 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.74 
 
 
1054 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 
1062 aa  552  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 
1022 aa  552  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  32.87 
 
 
1040 aa  550  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 
1054 aa  552  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 
1101 aa  547  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 
1067 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.09 
 
 
1024 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 
1029 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 
1054 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 
1033 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 
1028 aa  536  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.61 
 
 
1049 aa  529  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 
1036 aa  532  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 
1031 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 
1017 aa  523  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1038 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 
1045 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  32.77 
 
 
1035 aa  522  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 
1031 aa  521  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 
1031 aa  521  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 
1037 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 
1173 aa  519  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  30.67 
 
 
1026 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 
1044 aa  519  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 
1044 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 
1073 aa  513  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 
1044 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 
1046 aa  515  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 
1027 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 
1083 aa  510  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 
1018 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 
1023 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 
1177 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 
1027 aa  509  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.01 
 
 
1081 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  32.99 
 
 
1025 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  31.26 
 
 
1030 aa  505  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 
1050 aa  506  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 
1048 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 
1064 aa  505  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 
1040 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 
1086 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 
1033 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 
1033 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 
1023 aa  502  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 
1032 aa  500  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 
1102 aa  502  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 
1082 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  31.48 
 
 
1028 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.73 
 
 
1091 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 
1027 aa  498  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 
1044 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 
1051 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 
1087 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 
1171 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>