More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4611 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.65 
 
 
1645 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
1010 aa  805    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.13 
 
 
1711 aa  682    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  48.89 
 
 
1299 aa  710    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.98 
 
 
1152 aa  827    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 
1646 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.38 
 
 
1431 aa  825    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
1048 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.4 
 
 
1559 aa  680    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.09 
 
 
1514 aa  794    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 
1390 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
1013 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1002 aa  2035    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.12 
 
 
1426 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.97 
 
 
1514 aa  794    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
1361 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 
1003 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.58 
 
 
1651 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  48.45 
 
 
1427 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.07 
 
 
1131 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.17 
 
 
1140 aa  742    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.35 
 
 
1406 aa  713    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.58 
 
 
1415 aa  690    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.12 
 
 
1390 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  48.82 
 
 
1202 aa  737    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.18 
 
 
1631 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.79 
 
 
1383 aa  752    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 
1370 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.12 
 
 
1390 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.82 
 
 
1385 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.41 
 
 
1287 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
1248 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
1153 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 
1383 aa  594  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
1118 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.15 
 
 
1051 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  43.18 
 
 
919 aa  549  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  30.5 
 
 
1614 aa  350  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  35.48 
 
 
1816 aa  331  4e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  40.77 
 
 
1180 aa  297  7e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  38.73 
 
 
1156 aa  293  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  37 
 
 
1172 aa  273  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
979 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  34.15 
 
 
1366 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  33.47 
 
 
1378 aa  258  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
816 aa  256  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
975 aa  255  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  31.78 
 
 
1373 aa  254  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  36.99 
 
 
1311 aa  254  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
837 aa  254  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  37.44 
 
 
904 aa  253  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  32.77 
 
 
1373 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  39.61 
 
 
519 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  28.94 
 
 
816 aa  249  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
587 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  35.35 
 
 
1374 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.25 
 
 
1301 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  31.98 
 
 
934 aa  247  8e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  37.18 
 
 
1344 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  32.94 
 
 
1384 aa  244  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  35.16 
 
 
876 aa  243  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  34.46 
 
 
1343 aa  243  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  35.94 
 
 
1355 aa  241  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.8 
 
 
628 aa  241  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  34.06 
 
 
1418 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
1036 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
978 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  35.06 
 
 
1306 aa  238  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  34.02 
 
 
1397 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.41 
 
 
708 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  32.53 
 
 
1370 aa  234  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  35.71 
 
 
663 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  32.68 
 
 
1344 aa  231  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.14 
 
 
934 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.43 
 
 
1557 aa  230  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32.32 
 
 
1347 aa  230  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
1341 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.4 
 
 
1965 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.38 
 
 
1478 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  33.66 
 
 
1355 aa  228  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.86 
 
 
1297 aa  227  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  34.11 
 
 
1366 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  34.64 
 
 
1378 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.81 
 
 
955 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  52.59 
 
 
1399 aa  226  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
818 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.71 
 
 
1255 aa  224  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  35.02 
 
 
1298 aa  224  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 
1287 aa  224  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
677 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.61 
 
 
1068 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  31.88 
 
 
1340 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
889 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
1331 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 
1349 aa  221  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  31.05 
 
 
1400 aa  221  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.43 
 
 
1501 aa  221  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.03 
 
 
720 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.71 
 
 
1419 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 
1207 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>