More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0330 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 875 aa  731    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 876 aa  738    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 876 aa  737    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 872 aa  697    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 874 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 875 aa  702    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 874 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 876 aa  779    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 874 aa  720    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 867 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0862  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 877 aa  639    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.74806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 884 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 880 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 876 aa  675    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 880 aa  644    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 885 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 874 aa  712    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 874 aa  695    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 880 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 892 aa  712    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 880 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 874 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 860 aa  691    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 860 aa  695    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 899 aa  678    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 890 aa  653    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 871 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0728  alanyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 886 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.846267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 874 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 874 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 886 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 891 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 880 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 874 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  44.85 
 
 		 873 aa  693    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 874 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 883 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 882 aa  745    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 897 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 		 887 aa  1128    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 		 886 aa  1182    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 876 aa  732    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 880 aa  699    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 864 aa  725    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 880 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 874 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 874 aa  718    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 862 aa  706    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2818  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 883 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 881 aa  707    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 874 aa  693    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 905 aa  691    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 874 aa  684    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 892 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 881 aa  661    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 874 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 876 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 875 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 890 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 874 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 878 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 874 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 874 aa  715    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 891 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 868 aa  684    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 897 aa  656    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 890 aa  667    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 884 aa  718    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 883 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 902 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 875 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 897 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 865 aa  729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 878 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 877 aa  803    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2104  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 883 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653271  normal  0.762887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 863 aa  731    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 874 aa  712    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 874 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 874 aa  718    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 874 aa  715    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 869 aa  717    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 874 aa  726    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 880 aa  704    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1008  alanyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 884 aa  643    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 874 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 874 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 874 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 897 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 885 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 878 aa  696    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 874 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1029  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 845 aa  637    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00361534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 878 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 888 aa  1185    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 885 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 900 aa  707    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 867 aa  689    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 876 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 879 aa  710    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>