More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0709 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
465 aa  946    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  75.7 
 
 
465 aa  739    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  74.94 
 
 
435 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  71.11 
 
 
471 aa  651    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  77.63 
 
 
465 aa  734    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  64.3 
 
 
466 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  63.73 
 
 
466 aa  609  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  37.47 
 
 
465 aa  310  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 
1694 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
466 aa  177  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
1276 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
468 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
467 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
878 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.84 
 
 
810 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.61 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
562 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
927 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
4489 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
685 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
4079 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
711 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.47 
 
 
1007 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
955 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
1049 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.89 
 
 
573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 
1979 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
681 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.78 
 
 
730 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.49 
 
 
1676 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.91 
 
 
707 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
486 aa  126  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
1192 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
1276 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.12 
 
 
745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
3035 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.03 
 
 
816 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.74 
 
 
725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
1069 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
602 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 
909 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1094 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 
620 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
1737 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
761 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
617 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.57 
 
 
576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.47 
 
 
564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.51 
 
 
818 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.43 
 
 
620 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
3560 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.66 
 
 
1138 aa  113  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06745  TPR repeat protein  23.88 
 
 
463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
3301 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
634 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 
1056 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 
784 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.81 
 
 
865 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
732 aa  110  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
279 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  29.28 
 
 
314 aa  109  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
637 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.56 
 
 
1013 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.07 
 
 
988 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 
714 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
740 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.82 
 
 
2240 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
523 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.18 
 
 
635 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
615 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.11 
 
 
887 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 
329 aa  106  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.29 
 
 
1067 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
344 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.27 
 
 
1022 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.39 
 
 
764 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  29.09 
 
 
417 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
448 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.73 
 
 
936 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.2 
 
 
296 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
935 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  25.85 
 
 
623 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
505 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
1297 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 
363 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.25 
 
 
795 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
804 aa  103  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
467 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.25 
 
 
784 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
605 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
452 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.47 
 
 
1056 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.6 
 
 
703 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>