More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0766 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 763 aa  1580    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  34.78 
 
 		 848 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  36.72 
 
 		 833 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 778 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 719 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 748 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 760 aa  200  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  27.48 
 
 		 750 aa  191  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 753 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 720 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  23.32 
 
 		 720 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 720 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 721 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.08 
 
 		 659 aa  126  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 713 aa  124  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  25.23 
 
 		 641 aa  124  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 663 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.08 
 
 		 663 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.74 
 
 		 639 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.08 
 
 		 663 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.08 
 
 		 663 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 726 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.92 
 
 		 663 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.92 
 
 		 663 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.06 
 
 		 633 aa  120  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.87 
 
 		 656 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 733 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.52 
 
 		 650 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.04 
 
 		 650 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  23.19 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.32 
 
 		 650 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.32 
 
 		 650 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.32 
 
 		 650 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  22.34 
 
 		 700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 734 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 688 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1128 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 745 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  24.89 
 
 		 640 aa  108  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  22.76 
 
 		 687 aa  107  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 845 aa  106  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 757 aa  105  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 613 aa  105  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 661 aa  104  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  22.72 
 
 		 696 aa  102  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 680 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 662 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  28.09 
 
 		 656 aa  100  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 747 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 648 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 657 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 649 aa  99.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 662 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.54 
 
 		 695 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  38.52 
 
 		 677 aa  97.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 649 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  24.95 
 
 		 676 aa  96.3  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  21.57 
 
 		 702 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 817 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 653 aa  95.1  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 769 aa  94.7  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  22.03 
 
 		 698 aa  94.7  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 681 aa  93.6  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 783 aa  91.3  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  31.97 
 
 		 618 aa  90.9  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25 
 
 		 696 aa  89.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  23.01 
 
 		 668 aa  89.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  22.59 
 
 		 696 aa  89.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25 
 
 		 696 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 735 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.04 
 
 		 653 aa  89.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 924 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  29.39 
 
 		 799 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 686 aa  88.6  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  25.55 
 
 		 704 aa  88.6  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  21.19 
 
 		 772 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 681 aa  88.2  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  39.23 
 
 		 650 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 705 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 893 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 702 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  24.16 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 635 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 933 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 694 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  24.44 
 
 		 807 aa  84.7  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 699 aa  84.7  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 918 aa  84.7  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  25.25 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  36.5 
 
 		 647 aa  84  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 682 aa  84  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 701 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 824 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 698 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  24.84 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.26 
 
 		 666 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>