More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2699 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  56.46 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  58.74 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  57.97 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  52.63 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  56.22 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  53.96 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  56.19 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  56.52 
 
 		 214 aa  207  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  53.4 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  57.75 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  60.2 
 
 		 244 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  52.94 
 
 		 211 aa  201  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  59.47 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  58.42 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  55.83 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 234 aa  197  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  56.63 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  50.47 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 221 aa  195  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  52.82 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  54.11 
 
 		 226 aa  194  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  54.23 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  54.21 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  52.63 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  52.31 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  51.79 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  53.85 
 
 		 252 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  52.88 
 
 		 246 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  56.52 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  54.55 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  51.81 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  50.78 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  51.81 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  51.69 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  54.26 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  52.88 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  48.8 
 
 		 217 aa  174  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  48.04 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  51.6 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  50.96 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  43.22 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  48.72 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  48.15 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  44.34 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  48.04 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.58 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.5 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  46.89 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.51 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  48.37 
 
 		 686 aa  161  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 901 aa  161  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  43.66 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  48.4 
 
 		 244 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.91 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  39.29 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 204 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 225 aa  157  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  46.11 
 
 		 705 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.95 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  46.67 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.12 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  44.23 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  44.39 
 
 		 703 aa  154  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  48.4 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  38.35 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 225 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  46.91 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  38.42 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  43.54 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>