More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0839 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1207 aa  2471    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
953 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.57 
 
 
799 aa  483  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.17 
 
 
839 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
965 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
1070 aa  386  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
933 aa  335  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
1202 aa  332  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  28.74 
 
 
1177 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
829 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
1291 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 
557 aa  292  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1122 aa  289  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
1659 aa  289  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 
1629 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  30.45 
 
 
1629 aa  283  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
1625 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
1629 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 
1245 aa  278  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
1118 aa  274  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.3 
 
 
1632 aa  271  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.59 
 
 
1177 aa  268  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 
553 aa  268  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
944 aa  254  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
1079 aa  244  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
1060 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
640 aa  243  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
1043 aa  240  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
1039 aa  240  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
634 aa  230  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
1026 aa  230  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
737 aa  228  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
1021 aa  226  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
1042 aa  226  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
637 aa  224  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
902 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
955 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
1297 aa  220  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
1271 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
910 aa  217  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.24 
 
 
1169 aa  217  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
1002 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 
591 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
1229 aa  213  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  32.1 
 
 
1111 aa  211  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  36.76 
 
 
762 aa  211  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
823 aa  211  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 
1193 aa  210  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.07 
 
 
1468 aa  210  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
1120 aa  209  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
1230 aa  210  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.09 
 
 
1622 aa  208  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 
1237 aa  208  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 
1478 aa  208  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 
1287 aa  208  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
871 aa  207  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 
1245 aa  207  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
687 aa  207  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  25.62 
 
 
1317 aa  206  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
1350 aa  206  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
1044 aa  205  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 
1149 aa  204  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.93 
 
 
1238 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 
1480 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
638 aa  203  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
1238 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 
1234 aa  202  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.08 
 
 
911 aa  202  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 
1238 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 
1238 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 
882 aa  201  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  26.08 
 
 
1236 aa  201  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
758 aa  201  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  26.75 
 
 
1131 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.78 
 
 
1245 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  26.89 
 
 
1188 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 
1088 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
1236 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
1064 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  30.33 
 
 
1161 aa  199  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 
1266 aa  199  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1083  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.38 
 
 
812 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
1236 aa  199  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  25.86 
 
 
1200 aa  199  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
1236 aa  199  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
1195 aa  198  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
492 aa  198  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
595 aa  197  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
865 aa  197  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
979 aa  197  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 
1236 aa  197  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1419 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 
698 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
1142 aa  195  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  24.75 
 
 
1763 aa  195  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
1287 aa  195  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.38 
 
 
1611 aa  195  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 
503 aa  194  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.76 
 
 
1501 aa  194  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
1603 aa  194  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>