222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7225 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  299  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  63.7 
 
 		 153 aa  166  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  56.3 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  55.74 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  55.74 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  45.54 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  40.56 
 
 		 170 aa  90.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  34.51 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  38.28 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  37.61 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  35.59 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34.94 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  33.33 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  40.58 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  30.08 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  32.54 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2045  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 203 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>