95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0484 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 		 656 aa  1304    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.52 
 
 		 624 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  36.57 
 
 		 635 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  35.34 
 
 		 714 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  40.96 
 
 		 673 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  33.53 
 
 		 688 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.53 
 
 		 663 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  36.09 
 
 		 661 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  36.79 
 
 		 678 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  45.97 
 
 		 609 aa  193  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  41.83 
 
 		 1037 aa  187  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  44.28 
 
 		 627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.8 
 
 		 905 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  41.9 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.99 
 
 		 871 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  34.83 
 
 		 635 aa  181  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.81 
 
 		 847 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.05 
 
 		 1412 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  39.88 
 
 		 1192 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  36.31 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  40.67 
 
 		 1073 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  36.83 
 
 		 667 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  39.2 
 
 		 976 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.37 
 
 		 684 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.53 
 
 		 885 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.38 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  39.35 
 
 		 554 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  37.5 
 
 		 998 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  33.67 
 
 		 589 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.39 
 
 		 464 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  38.74 
 
 		 682 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.38 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.83 
 
 		 719 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.38 
 
 		 600 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.01 
 
 		 510 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.79 
 
 		 706 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.14 
 
 		 860 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  34.13 
 
 		 643 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.21 
 
 		 769 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  32.39 
 
 		 1312 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  34.55 
 
 		 841 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  29.75 
 
 		 1550 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  32.23 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  27.87 
 
 		 600 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.87 
 
 		 2884 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  26.95 
 
 		 1452 aa  98.6  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.33 
 
 		 619 aa  99  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.12 
 
 		 543 aa  93.2  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  29.55 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  26.32 
 
 		 570 aa  92  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  33.53 
 
 		 538 aa  91.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.45 
 
 		 962 aa  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  25.78 
 
 		 600 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.83 
 
 		 326 aa  87.4  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.91 
 
 		 1045 aa  86.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.69 
 
 		 530 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  26.14 
 
 		 640 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.5 
 
 		 749 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.58 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.51 
 
 		 600 aa  67.8  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.58 
 
 		 342 aa  66.6  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  23.76 
 
 		 795 aa  64.3  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  26.1 
 
 		 833 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.45 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.67 
 
 		 1059 aa  62.4  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.71 
 
 		 1916 aa  57.4  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.99 
 
 		 717 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  32.71 
 
 		 428 aa  50.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  34.02 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  34.02 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  34.02 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  31.96 
 
 		 1060 aa  48.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  32.99 
 
 		 1066 aa  48.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  34.02 
 
 		 1062 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  34.02 
 
 		 1062 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.25 
 
 		 1256 aa  47.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  34.02 
 
 		 445 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  34.02 
 
 		 1049 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.82 
 
 		 567 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.91 
 
 		 686 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0810  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.24 
 
 		 719 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0412357  normal  0.0214856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  31.3 
 
 		 1010 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  32.99 
 
 		 1062 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  31.58 
 
 		 1111 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  36.71 
 
 		 434 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0405  PKD domain-containing protein  30.84 
 
 		 1141 aa  45.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  31.96 
 
 		 1065 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  31.18 
 
 		 1138 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  30.93 
 
 		 1067 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  31.65 
 
 		 1062 aa  44.3  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.99 
 
 		 668 aa  44.3  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 646 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  30.77 
 
 		 1081 aa  44.3  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  37.84 
 
 		 437 aa  43.9  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  35.44 
 
 		 434 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>