More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2573 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  61.93 
 
 		 1062 aa  1371    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 1071 aa  2211    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  63.32 
 
 		 1069 aa  1415    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  60.44 
 
 		 1049 aa  1345    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  62.05 
 
 		 1062 aa  1371    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  63.08 
 
 		 1067 aa  1426    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  61.28 
 
 		 1062 aa  1357    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  62.6 
 
 		 598 aa  801    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  46.42 
 
 		 1084 aa  1011    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  50.66 
 
 		 1138 aa  1135    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  62.17 
 
 		 1065 aa  1360    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  61.65 
 
 		 1062 aa  1362    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  45.5 
 
 		 1078 aa  974    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  48.27 
 
 		 1113 aa  1046    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  62.18 
 
 		 1066 aa  1384    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  62.12 
 
 		 1062 aa  1364    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  61.74 
 
 		 1062 aa  1361    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  63.12 
 
 		 1081 aa  1402    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  62.13 
 
 		 1060 aa  1384    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  44.9 
 
 		 1062 aa  986    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  49.54 
 
 		 1111 aa  1080    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  61.45 
 
 		 1062 aa  1354    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  61.81 
 
 		 1062 aa  1379    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  61.06 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  28.48 
 
 		 1052 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.21 
 
 		 1005 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1042 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.34 
 
 		 1042 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.43 
 
 		 1040 aa  208  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  24.28 
 
 		 1014 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.54 
 
 		 1059 aa  184  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.75 
 
 		 1031 aa  167  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  23.82 
 
 		 1010 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.38 
 
 		 666 aa  114  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  23.5 
 
 		 1082 aa  99  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  24.66 
 
 		 1084 aa  94.7  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  24.59 
 
 		 686 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.27 
 
 		 1090 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  24.31 
 
 		 1167 aa  91.3  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.69 
 
 		 440 aa  90.9  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  23.15 
 
 		 1097 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.3 
 
 		 717 aa  88.6  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.78 
 
 		 430 aa  87.4  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  24.68 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  24.7 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  22.85 
 
 		 1067 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  26.44 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  23.17 
 
 		 680 aa  82  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  24.37 
 
 		 459 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.84 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 		 646 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  24.62 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  22.99 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  22.33 
 
 		 1075 aa  78.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.03 
 
 		 1125 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.24 
 
 		 433 aa  77.4  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  23.61 
 
 		 585 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.7 
 
 		 407 aa  76.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.77 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.15 
 
 		 292 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.1 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.47 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  32.28 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.35 
 
 		 670 aa  75.1  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  32.53 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  27.7 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.06 
 
 		 673 aa  74.7  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 436 aa  74.3  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  23.61 
 
 		 415 aa  74.7  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  23.81 
 
 		 1076 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.93 
 
 		 426 aa  73.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  30.13 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24.32 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  27.7 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  21.4 
 
 		 672 aa  72.8  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  22.86 
 
 		 1079 aa  72  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.45 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.89 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  26.75 
 
 		 445 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.75 
 
 		 720 aa  70.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  24.15 
 
 		 431 aa  71.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  32.32 
 
 		 442 aa  70.1  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.27 
 
 		 512 aa  70.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.4 
 
 		 407 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  23.4 
 
 		 480 aa  70.1  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  22.89 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  26.48 
 
 		 1084 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  23.82 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.7 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  36.11 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  25.81 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.4 
 
 		 709 aa  68.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  22.94 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>